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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » CIF专栏 » 关于溶剂水加氢的A类、B类错误
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baox1991955

铜虫 (小有名气)

[交流] 关于溶剂水加氢的A类、B类错误

请问这些错误提示是什么意思啊 是我给溶剂水加的氢有问题吗？
PLAT245_ALERT_2_A U(iso) H6WA    Smaller than U(eq) O6W     by ...       0.16 AngSq
PLAT245_ALERT_2_A U(iso) H6WB    Smaller than U(eq) O6W     by ...       0.17 AngSq
PLAT420_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-D       H3WB   ..  H6WB    ..       2.08 Ang.
PLAT417_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-D       H5WA   ..  H6WA    ..       2.09 Ang.
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor       O5W    -   H5WA   ...          ?      
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor       O6W    -   H6WB   ...          ?
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1楼 2009-04-26 09:59:48
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★
waiy2001(金币+1,VIP+0): 4-26 15:29
水上氢的Ueq要设成-1.5或-1.2, 不能比母原子还小。

H5Wa， H6WB没有形成氢键，这不对， 要重新加。

H3WB,H5WA和水O6W上的氢距离太近， 要重新加。
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xi2004-emuch@163.com
2楼2009-04-26 10:39:46
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baox1991955

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xi2004 at 2009-4-26 10:39:
水上氢的Ueq要设成-1.5或-1.2, 不能比母原子还小。

H5Wa， H6WB没有形成氢键，这不对， 要重新加。

H3WB,H5WA和水O6W上的氢距离太近， 要重新加。

请问“水上氢的Ueq要设成-1.5或-1.2”这个要怎么设呢？能不能告诉我具体的操作呢 ？谢谢？
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3楼2009-04-26 10:54:13
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★ ★
waiy2001(金币+2,VIP+0): 4-26 15:29
就是首先要吧H排到相应的母原子后面。 然后把其Ueq改成-1.5000或-1.20000

比如

o1w 4  x y z 11.0 ....
H1Wa 2 x y z 11.0 -1.5
h1wb 2 x y z  11.0 -1.5
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xi2004-emuch@163.com
4楼2009-04-26 11:11:36
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baox1991955

铜虫 (小有名气)
我试过了，果然可以，谢谢啦！还有个问题想问一下。我每次检查时都会遇到这样的问题 ，这个是什么意思呢？PLAT122_ALERT_1_A No _symmetry_space_group_name_H-M Given ........          ?
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5楼2009-04-26 11:15:21
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★ ★ ★
waiy2001(金币+3,VIP+0): 4-26 15:29
按照checkcif给你的提示 (最开始, 左边一列 Calculated下面)
在CIF文件中, 添加一行就可以了.

比如

_symmetry_space_group_name_H-M    'P 21/c'
_symmetry_space_group_name_Hall   '-P 2ybc'


这后一行,就是新添的.
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xi2004-emuch@163.com
6楼2009-04-26 11:40:16
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baox1991955

铜虫 (小有名气)
真是太感谢啦！好心人啊！
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7楼2009-04-26 14:28:53
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zhaoyangqufu

至尊木虫 (知名作家)
LZ还是表示一下吧
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8楼2009-04-26 19:35:15
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baox1991955

铜虫 (小有名气)
要怎样给金币呢？我不会啊.
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9楼2009-04-28 08:32:56
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★
洛阳学子(金币+1,VIP+0):谢谢您对晶体版的支持 4-28 12:07
引用回帖:
Originally posted by baox1991955 at 2009-4-28 08:32:
要怎样给金币呢？我不会啊.

不必客气.
互相帮助嘛!
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xi2004-emuch@163.com
10楼2009-04-28 08:49:01
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