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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 【求助】【求助】配位数的计算
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chunwang

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】【求助】配位数的计算

用分子动力学模拟得到了径向分布函数，但不知道在程序里怎样实现配位数的计算。计算公式知道，就是不知道怎么操作，还请各位高手指点指点！

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 19:58 ]
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1楼2009-04-23 17:27:13
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chunwang

铜虫 (小有名气)
各位大侠一定要帮忙哦！
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2楼2009-04-23 17:33:29
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jqhejia

银虫 (正式写手)
同问，帮顶！
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3楼2009-04-23 17:34:01
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lei0736

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主
★
xuefei06(金币+1,VIP+0):感谢你的参与！ 4-24 00:41
如果你想算第一近邻个数 选第一峰和第二峰之间的最低点作为截尾去判断就是了 其他以此类推
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4楼2009-04-23 20:22:45
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yzhhlq_1983

木虫 (正式写手)
★
xuefei06(金币+1,VIP+0):感谢你的参与！ 4-24 00:42
楼上的是正解，一般配位数是指第一配位圈的原子个数。得到了径向分布函数，乘上主体相密度积分即可
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5楼2009-04-23 20:41:37
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chunwang

铜虫 (小有名气)
非常感谢，但还是不知道这个积分怎么做，在请教请教！
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6楼2009-04-24 11:19:34
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chunwang

铜虫 (小有名气)
7楼2009-04-24 11:20:38
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lei0736

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1097929&fpage=1 希望这里能给你一个满意的答复
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8楼2009-04-24 18:19:45
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老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 4-27 08:58
你算不出配位数，那是怎么算出RDF的呢？用MD算RDF，第一步是找出不同距离内的配位数，第二步是归一化得到RDF。

如果你只有一个RDF曲线，然后再通过积分来反算配位数，可能会有一些计算误差的。
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9楼2009-04-24 21:12:19
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lei0736

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主
确实 在算RDF的时候已经算过一遍配位数了
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10楼2009-04-24 22:00:04
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