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sym1979铁杆木虫 (正式写手)
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cif有这个c类错误怎么解决呢
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DIFMX01_ALERT_2_C The maximum difference density is > 0.1*ZMAX*0.75 _refine_diff_density_max given = 0.651 Test value = 0.600 DIFMX02_ALERT_1_C The maximum difference density is > 0.1*ZMAX*0.75 The relevant atom site should be identified. 如何在'_publ_section_exptl_refinement'中解释呢？ 一般情况下the location and subsequent refinement of the O-H and N-H protons，这个加氢模式是不是也要特别提出来的？ |
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xi2004
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waiy2001(金币+1,VIP+0):谢谢了,同时学习了 4-25 13:16
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你这个是有机分子. 而且其他残余峰均在0.2以下. 所以这个0.65的残余峰是不能忽略的. 我给你做了无序处理, 即认为那个甲基是在两个可能的位置. 这样所有的相关alert都消失了. 从结构的角度来说,我认为这样是最佳处理了. 但你认为从合成的角度和有机化学角度来看,甲基是能唯一确定的,只能在原来确定的那个与C13相连的位置, 那么,上述说到的哪些alert c是不可能解决的. 而你的结构不没有重原子, 所以也不能象一般这种情况下说的那样" the maximum residual electron density of 0.65 e/a3 is located near C12 with a distance of 1.39 angstrom and shows no feature. " 总而言之, 我认为要么你take我的处理, 要么就不能解释这些alert. 请从合成的角度再想想. |
7楼2009-04-24 11:45:43
lizuoxi
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2楼2009-04-22 19:25:41
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3楼2009-04-22 22:00:47
sym1979
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The maximum residual electron density is larger than normally expected, even after making an allowance for the heaviest element in the structure. This is often an indication that (a) the absorption corrections are inadequate; (b) the overall quality of the data may be poor, leading to spurious peaks and holes of residual electron density; (c) there is twinning which has not been allowed for where overlap from the second twin domain (which may have been ignored in the data collection) causes errors in the intensities of some reflections; (d) the model is incorrect or incomplete in terms of incorrect element assignment, missing atoms or unmodelled or inadequately modelled disorder or solvent atoms. If you believe you have eliminated all potential causes of this alert, but the maximum residual electron density still remains larger than normally expected, you must specify the name of the nearest atom to this minimum and its distance from the minimum. 在线检测是这个答案，大家都是怎么解决的呢 |
4楼2009-04-22 22:06:34
