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loovfnd

至尊木虫 (著名写手)

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专业: 物理有机化学

[交流] 【转帖】高斯批处理的输入。

1）若用Windows系统可以直接编辑，给你文件样本，编写内容如下的文本文件，命名name.bcf

!
!user created batch file list
!start=1
!
a.gjf , a.out
b.gjf , b.out

2）用NQS 批处理
Gaussian可以使用UNIX系统支持的NQS批处理工具。初始化文件中定义的subg03命令可
以把输入任务提交到批处理序列中。它的语法是：
Subg03 序列名任务名 [-scrdir dir1] [-exedir dir2] [-p n]
两个必需的参数是序列名和文件名。输入来自job-name.com，输出为job-namelog，与
交互运行一样。NQS日志文件发送到job-name.batch-log。可选的参数-scrdir和-exedir分
别用于代替默认的scratch和执行目录。其它参数来自NQS选项。特别是-p n可用于设置序列
中优先为n。它在启动时优先计算（1是最低的），并不影响运行时间的优先权。
从交互方式提交NQS任务，需要创建类似于下面的文件（文件名为name.job）：
# QSUB –r name –o name.out –eo
# QSUB –lt 2000 –lT 2100
# QSUB –lm 7mw –lM 7mw
g98 其中的name应当用实际计算使用的名称代替。第一行命名运行的任务，输出文件名，以及在
输出文件中包含出错信息。不同的时间参数允许加入用于清除的任务控制（例如，如果事件
超过运行时间限制，就保存checkpoint文件）。内存参数用于最初执行任务的时间安排，以
及由程序确定动态内存的使用。
这个任务接下来使用以下的命令提交：
$ qsub name.job
输出的文件将放在当前的工作目录。

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莫强求！

1楼 2009-04-22 12:50:12

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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

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引用回帖:

Originally posted by snoopyzhao at 2009-5-18 14:23:
在 Linux 下，建议启动 screen，然后在 screen 中运行脚本，这样就不需要 nohup 之类的了。

[code]
screen

for i in `ls *.com`; do
j=`echo $i | sed 's/.com//g'`
g03 < $i > $j.log
done
[/c ...

学习了

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