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xi2004

至尊木虫 (职业作家)


hljiang(金币+1,VIP+0):谢谢兄台高见 4-25 15:42
我下载别人的cif看,发现别人的cif里面根本就是一个框架结构,没有发现有游离的溶剂分子存在。好几个化合物发表在不同刊物上的,都是这个样子。


早一点的文章, 很多数据并不好, 有时晶格水并没有加, 也可以发表. 后来, 有人用platon里的squeez. 你注意看看人家文章里是如何处理这个问题的.
xi2004-emuch@163.com
11楼2009-04-25 14:57:31
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hljiang

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by xi2004 at 2009-4-25 14:57:
我下载别人的cif看,发现别人的cif里面根本就是一个框架结构,没有发现有游离的溶剂分子存在。好几个化合物发表在不同刊物上的,都是这个样子。


早一点的文章, 很多数据并不好, 有时晶格水并没有加, 也可以发 ...

都是最近发表的。

要不我给个原始数据给你,你能否帮忙处理看看?

如果可以,能否把email给我一下?

多谢!
岂能尽如人意,但求无愧吾心
12楼2009-04-25 15:44:02
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crystalsnet

新虫 (正式写手)


paopaomeng(金币+1,VIP+0):谢谢交流 4-25 20:15
还有一种情况,您用晶体做的热重?
有时晶体和粉末差别较大,例如很多容易风化的晶体,粉末状态时,溶剂已经失去。而我们还在两边对照去定溶剂分子,可能否?
13楼2009-04-25 18:57:09
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lizuoxi

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by crystalsnet at 2009-4-25 18:57:
还有一种情况,您用晶体做的热重?
有时晶体和粉末差别较大,例如很多容易风化的晶体,粉末状态时,溶剂已经失去。而我们还在两边对照去定溶剂分子,可能否?

这个长见识
14楼2009-04-25 21:32:40
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chemlijing

木虫 (小有名气)


waiy2001(金币+1,VIP+0): 4-26 15:27
需要申请CCDC号,在申请之前要把水分子的个数定好才可以。因此在此之前必须优化结构。
15楼2009-04-26 08:17:54
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hljiang

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by crystalsnet at 2009-4-25 18:57:
还有一种情况,您用晶体做的热重?
有时晶体和粉末差别较大,例如很多容易风化的晶体,粉末状态时,溶剂已经失去。而我们还在两边对照去定溶剂分子,可能否?

谢谢建议,我都是用晶体做的热重,所以可能不存在这个问题。
岂能尽如人意,但求无愧吾心
16楼2009-04-26 11:52:05
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hljiang

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by chemlijing at 2009-4-26 08:17:
需要申请CCDC号,在申请之前要把水分子的个数定好才可以。因此在此之前必须优化结构。

谢谢。
不过别人和我一样的或者同构的数据,人家定成4.3个水分子,但是CCDC上download他们的cif文件或者直接从supporting information中download的cif文件中并没有定游离的溶剂分子

不知道为什么?
岂能尽如人意,但求无愧吾心
17楼2009-04-26 11:56:32
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)


waiy2001(金币+1,VIP+0):辛苦了,呵呵 4-26 15:27
我粗看了一下, 水和DMF也许都在.

个人浅见,既然结构和别人的一样, 就不要再申请CCDC号了吧。而且我觉得也没有必要发表这个结构了。因为你要做的是催化。

光从单晶结构,恐怕是定不了到底有几个水和几个DMF.
要依靠EA等数据。

当然,我会再帮你看看结构。
xi2004-emuch@163.com
18楼2009-04-26 12:32:53
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hljiang

铁杆木虫 (著名写手)

elemental analysis, TGA我都有做。

EA我没有仔细分析,但是TGA支持有4.3个游离水分子或者1个DMF分子。
岂能尽如人意,但求无愧吾心
19楼2009-04-26 13:41:24
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

★ ★ ★ ★
waiy2001(金币+3,VIP+0):辛苦了,呵呵 4-27 13:20
hljiang(金币+1,VIP+0):金币有点少,不过只剩下1个了,感谢帮助! 4-27 19:21
我再尝试了一下, 由于高度无序, 已经肯定无法利用单晶结构来确定孔洞中游离物是DMF还是水,或者是两者皆有.

   结合你的TGA数据,我个人倾向于是DMF+水, 而且是DMF居多. 为何这样说呢? 因为在100度之前, 有所失重, 我认为这个应该是晶格水+配位水. 然后有个平台到140, 这之后到下一个平台的失重是DMF, 你可以基于这个判断来初步确定水和DMF的比例. 再结合你的EA数据, 或许可以得出比较合理的DMF:H2O的比例

  我看了一下以前报道了n次的同构化合物, 确定他们都没有完全确定孔洞中的游离分子. 这些人包括Yaghi, Zhu GuanShan, Chen JieShen, Luo Junhua. 值得一提的是,其中除了Eu的化合物外, 其他几个结构它们都把配位水处理成无序.
  Luo Junhua的结构和你的基本上是一个东西, 但1.其配位水无序在两个位置. 而你的完全有序在特殊位置. 2.其所含溶剂分子有可能与你的不同. 3.他的数据不如你的好. 基于这些考虑. 你如果要再发表一次Y(BTC)(H2o).DMF.H2O的结构还是有意义的.

   但一定要
1. 靠TGA和EA等来尽量确定好分子式后, 使得单晶结构有正确的分子式
2. 其中单晶结构中溶剂分子的处理, 你可以不做处理,就是不加为原子, 也可以用squeez来处理. 两者我认为都是可以.
   squeez我没怎么用过,帮不了你. 注意你的同构化合物,有人已经这么处理过了.

   总之不要幻想能通过单晶结构分析来确定孔洞中的游离分子,而要利用其他表征. 利用其他表征确定了分子式后, 再反过来结束结构精修,最后,可以deposit crystal data到CCDC.

  我还有个建议, 就是既然失去游离分子后还是稳定的,何不单晶测试一下加热都300度后的晶体? 这时候,应该没有游离分子了.
xi2004-emuch@163.com
20楼2009-04-27 01:05:02
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