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dulei

木虫 (小有名气)

[交流] 求助连接问题!!!

我用Xba I和Nde I双酶切质粒PIB139,小片段很小(10bp),直接用纯化试剂盒回收纯化大片段(6000bp左右)。
用Xba I和Nde I双酶切质粒pTA2-Vgb质粒(在T载体pTA2上连了一个vgb基因,酶切位点都有,测序正确),回收500bp左右的vgb片段。

然后将酶切后的PIB139和vgb片段连接,可是连接了好几次都没有连接上。连接体系应该没有问题,做其它基因连接时,都很好就连上了。

跑胶验证过程,发现:回收的vgb基因片段量非常少,不知道是不是这个原因。
切胶时发现vgb片段的量还是挺多的,可是回收后就很少很少了,跑胶5uL都很难看见条带。是不是因为vgb条带太短(500bp左右),损失太大的原因啊。
Nde I酶切效率很低,切开的位点连接效率也很低,我用的是长时间的连接(和平末端连接时间差不多,2个小时左右)。但是一个菌落都不长。

有没有人连接过Xba I和Nde I双酶切产物的,麻烦说明一下连接步骤,越详细越好。在此谢过!!!!
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anik

银虫 (正式写手)


dulei(金币+1,VIP+0): 5-9 20:51
你用的试剂盒回收的吧,这个损失是挺大的。我最近做的酶切后也是很微弱,都不可以用来回收。
载体连接你可以再长时间,可以过夜连接,4度。
2楼2009-04-21 08:31:59
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zhyzx

金虫 (小有名气)

vgb片段有点小,我也遇到过这种情况,如果有条件的话,可以试试把这个片段用PCR做一下,再试试。
希望你有好的结果!
3楼2009-04-21 10:12:17
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elvias

铁杆木虫 (正式写手)

你应该看一下你的载体的说明,有的载体上Xba I的位点是甲基化的,不能被酶切开,你要转到dam阴性菌株扩增,提质粒后马上酶切。
PCR产物如果你觉得回收的少,你可以在过柱之前加入一倍体积的异丙醇,回收效率要高一点。

[ Last edited by elvias on 2009-4-21 at 13:17 ]
4楼2009-04-21 13:10:41
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