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justafly

木虫 (小有名气)

[交流] 结构解析时一个CH3OH找不到了,如何解决

我的晶体分子式为(C38H46N8O16Hg2)(2CH3OH),由于是对称分子,用XP解结构时,得到分子的一半时,包含一个溶剂甲醇分子,可是GROW时,得到的结构中只含有一个甲醇分子,另一个甲醇分子不见了,不知如何解决。
    本人是新手,指点时请详细些,不胜感激。
    另外,由于下载附件需要金币,本人把附件删除了,请虫友们原谅

[ Last edited by justafly on 2009-4-20 at 21:19 ]
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

★ ★ ★ ★ ★ ★
waiy2001(金币+1,VIP+0):那我就先谢了,学习一下,呵呵 4-21 10:08
justafly(金币+1,VIP+0):非常感谢,我马上试一试, 4-21 11:35
justafly(金币+3,VIP+0):多谢,我以后要好好学习 4-21 11:39
justafly(金币+1,VIP+0):多谢,我以后要好好学习.真是学无止境啊 4-21 12:09
你是要画图吗?

该化合物是分子?

你看看联系主体分子的那个对称操作是啥?
比如某个键是处于对称中心上, 假设该原子为C1
在XP中
envi C1
就可以知道
C1 和 C1A的距离, 而且C1A的 symmetry code为 2655

那么

sgen 2655

则连那个甲醇分子 也会出现.

不知道具体情况. 先这么一说.
xi2004-emuch@163.com
2楼2009-04-20 22:12:09
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justafly

木虫 (小有名气)

谢谢xi2004的帮助,已成功画出结构式。再次表示由衷的感谢。论坛里能人真多啊
3楼2009-04-21 13:22:28
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justafly

木虫 (小有名气)

另外,再问一下,对称产生的编号,如C1A,如何改成正常的编号,如C18,要是用NAME命令一个一个的来,那就太慢了。先往往这样做,特别烦人。先谢谢了
4楼2009-04-21 13:35:44
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

★ ★
洛阳学子(金币+2,VIP+0):感谢您对晶体版的支持 4-24 11:37
引用回帖:
Originally posted by justafly at 2009-4-21 13:35:
另外,再问一下,对称产生的编号,如C1A,如何改成正常的编号,如C18,要是用NAME命令一个一个的来,那就太慢了。先往往这样做,特别烦人。先谢谢了

对称产生的编号,为何要改成所谓正常的编号呢?
就是应该和原始原子的编号有所不同嘛.

如果要改, 一般要改成C18i ,i为上标之类的,
以求和键长表一致.

我建议如果在xp中画, 画一张有标的,再画一张没有标的.
然后这些label的改动可以在phostoshop等软件中按自己的要求来改动.
xi2004-emuch@163.com
5楼2009-04-23 23:06:46
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