24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2508  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

1553891

新虫 (初入文坛)

[交流] pdb转换data 已有4人参与

pdb文件用vmd转换成data文件怎么才能让导出的data文件有angle和bond信息

发自小木虫Android客户端
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子动力学-初级问题资源

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

三岁薇恩

新虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
老哥,VMD读入pdb文件具体怎么操作。
7楼2019-03-27 09:28:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

Nater1ver

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
转成xyz,用ms打开,setup,用msi2lmp转一下就有了,带-ignore参数,angle和bond的势函数自己填上

发自小木虫Android客户端
2楼2018-11-13 19:56:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luckied

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
2楼: Originally posted by Nater1ver at 2018-11-13 19:56:48
转成xyz,用ms打开,setup,用msi2lmp转一下就有了,带-ignore参数,angle和bond的势函数自己填上

您好,请问您说的-ignore参数是加在那里?

发自小木虫IOS客户端
3楼2019-03-07 18:01:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Nater1ver

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by luckied at 2019-03-07 11:01:04
您好,请问您说的-ignore参数是加在那里?
...

msi2lmp 文件名 -ignore,这种带-的参数其实是无所谓位置的,只要每个短语之间有空格隔开就可以了

发自小木虫Android客户端
4楼2019-03-07 23:53:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂 +7 吃口冰激凌 2026-04-07 7/350 2026-04-08 22:49 by bljnqdcc
[考研] 277求调剂 +16 倪建设 2026-04-06 16/800 2026-04-08 21:28 by zhouxiaoyu
[考研] 085801 总分275 本科新能源 求调剂 +4 bradoner 2026-04-08 5/250 2026-04-08 21:27 by cyh—315
[考研] 土木水利专硕276分求调剂 +6 我想上学!!6 2026-04-05 9/450 2026-04-08 17:45 by 宋小宝HQ
[考研] 考研调剂 +11 冰冰,,, 2026-04-07 11/550 2026-04-08 15:08 by Delta2012
[考研] 0702物理学学硕299求调剂 +4 祁柒连 2026-04-06 4/200 2026-04-08 13:56 by wutongshun
[考研] 机械工程264学硕求调剂 +3 qiushangxian 2026-04-06 3/150 2026-04-08 01:53 by Linzejun
[考研] 323求调剂 +3 林zlu 2026-04-07 4/200 2026-04-07 23:21 by lbsjt
[考研] 计算机11408 287 求调剂 +3 LiLe5 2026-04-07 3/150 2026-04-07 23:15 by shanqishi
[考研] 一志愿北京2,材料与化工308求调剂 +16 熊二想上岸 2026-04-04 17/850 2026-04-07 14:58 by BruceLiu320
[考研] 081200-11408-367学硕求调剂 +4 1_2_3111 2026-04-06 4/200 2026-04-07 08:13 by jp9609
[考研] 266分,一志愿电气工程,本科材料,求材料专业调剂 +9 哇呼哼呼哼 2026-04-02 10/500 2026-04-06 19:47 by jean5056
[考研] 085600,320分求调剂 +16 大馋小子 2026-04-04 17/850 2026-04-06 07:58 by MOF_Catal
[考研] 083200 333求调剂 +3 十二!! 2026-04-04 3/150 2026-04-05 08:28 by barlinike
[考研] 359求调剂 +7 hhhhaaaa$ 2026-04-04 7/350 2026-04-04 18:49 by imissbao
[考研] 306求调剂 +3 hyb上名工 2026-04-02 3/150 2026-04-04 18:12 by 热情沙漠
[考研] 一志愿0817化学工程与技术,求调剂 +24 我不是只因 2026-04-02 28/1400 2026-04-04 15:15 by dongzh2009
[考研] 求材料调剂 一志愿南昌大学 328分 +5 yyy..... 2026-04-03 5/250 2026-04-03 13:46 by 百灵童888
[考研] 生物学硕341求调剂 +4 你笑起来像云朵 2026-04-03 4/200 2026-04-03 10:32 by macy2011
[考研] 一志愿北交大材料工程总分358 +3 cs0106 2026-04-02 5/250 2026-04-02 11:37 by olim
信息提示
请填处理意见