24小时热门版块排行榜    

查看: 2460  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

1553891

新虫 (初入文坛)

[交流] pdb转换data 已有4人参与

pdb文件用vmd转换成data文件怎么才能让导出的data文件有angle和bond信息

发自小木虫Android客户端
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子动力学-初级问题资源

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Nater1ver

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by luckied at 2019-03-07 11:01:04
您好,请问您说的-ignore参数是加在那里?
...

msi2lmp 文件名 -ignore,这种带-的参数其实是无所谓位置的,只要每个短语之间有空格隔开就可以了

发自小木虫Android客户端
4楼2019-03-07 23:53:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

Nater1ver

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
转成xyz,用ms打开,setup,用msi2lmp转一下就有了,带-ignore参数,angle和bond的势函数自己填上

发自小木虫Android客户端
2楼2018-11-13 19:56:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luckied

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
2楼: Originally posted by Nater1ver at 2018-11-13 19:56:48
转成xyz,用ms打开,setup,用msi2lmp转一下就有了,带-ignore参数,angle和bond的势函数自己填上

您好,请问您说的-ignore参数是加在那里?

发自小木虫IOS客户端
3楼2019-03-07 18:01:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luckied

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by Nater1ver at 2019-03-07 23:53:47
msi2lmp 文件名 -ignore,这种带-的参数其实是无所谓位置的,只要每个短语之间有空格隔开就可以了
...

好的,谢谢您的解答

发自小木虫IOS客户端
5楼2019-03-08 08:34:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿211 0703方向310分求调剂 +3 努力奋斗112 2026-03-15 3/150 2026-03-16 16:44 by houyaoxu
[考研] 321求调剂 +5 大米饭! 2026-03-15 5/250 2026-03-16 16:33 by houyaoxu
[考研] 085600调剂 +5 漾漾123sun 2026-03-12 6/300 2026-03-16 15:58 by 漾漾123sun
[考研] 327求调剂 +6 拾光任染 2026-03-15 11/550 2026-03-15 22:47 by 拾光任染
[考研] 中科大材料与化工319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:10 by ms629
[基金申请] 面上和青基一样限30页不合理 +5 wowsunflower 2026-03-10 7/350 2026-03-14 17:21 by kingkocxr
[考研] 266求调剂 +4 学员97LZgn 2026-03-13 4/200 2026-03-14 08:37 by zhukairuo
[考研] 调剂 +3 13853210211 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:47 by JourneyLucky
[考研] 2026考研调剂+本科延边大学+山东大学+生物化学与分子生物学+有项目经验 +3 ccdsscjy 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:12 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工求调剂一志愿 985 总分 295 +8 dream…… 2026-03-12 8/400 2026-03-13 22:17 by 星空星月
[考研] 求材料调剂 +5 隔壁陈先生 2026-03-12 5/250 2026-03-13 22:03 by 星空星月
[考研] 281求调剂 +9 Koxui 2026-03-12 11/550 2026-03-13 20:50 by Koxui
[考研] 301求调剂 +6 Liyouyumairs 2026-03-11 6/300 2026-03-13 20:11 by JourneyLucky
[考研] 材料工程调剂 +4 咪咪空空 2026-03-11 4/200 2026-03-13 19:57 by JourneyLucky
[考研] 0703化学求调剂 +7 绿豆芹菜汤 2026-03-12 7/350 2026-03-13 17:25 by njzyff
[考研] 一志愿211化学学硕310分求调剂 +8 努力奋斗112 2026-03-12 9/450 2026-03-13 15:41 by JourneyLucky
[考研] 314求调剂 +7 无懈可击的巨人 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:40 by JourneyLucky
[考研] 277求调剂 +4 anchor17 2026-03-12 4/200 2026-03-13 11:15 by 白夜悠长
[考研] 270求调剂 085600材料与化工专硕 +3 YXCT 2026-03-11 3/150 2026-03-13 10:13 by houyaoxu
[考博] 26读博 +4 Rui135246 2026-03-12 10/500 2026-03-13 07:15 by gaobiao
信息提示
请填处理意见