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龙之心木虫 (正式写手)
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[交流]
【求助】请问我的模拟结果为什么大都只有两个yes？
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我用Gaussian03来模拟两三个有机小分子之间的反应，想进行机理的计算。而且也有相似的文献报道。我只是把文献中的结构稍微改变了一下，用于我的体系中。 但是模拟出来的结果大多数都是 力符合，两个yes，而位移不符合，都是no， 把步长改为1以后出来的结果还是一样。请问这是为什么啊？有什么好的解决办法或者技巧吗？谢谢大家。 初学者提问，勿拍板砖，呵呵。 |
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2楼2009-04-20 11:04:50
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5楼2009-04-21 10:48:04
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龙之心(金币+2,VIP+0):很详细，谢谢。 4-21 15:45
yuhuobuku(金币+2,VIP+0):欢迎参加讨论 4-22 11:39
龙之心(金币+2,VIP+0):很详细，谢谢。 4-21 15:45
yuhuobuku(金币+2,VIP+0):欢迎参加讨论 4-22 11:39
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Item Value Threshold Converged? Maximum Force 0.000013 0.000450 YES RMS Force 0.000004 0.000300 YES Maximum Displacement 0.010966 0.001800 NO RMS Displacement 0.002075 0.001200 NO 我做了优化加频率 没有虚频 最后也只有两个yes。 看书上说，只有前两个yes是允许的，这种对于大分子比较常见。 |
6楼2009-04-21 11:07:05
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龙之心(金币+2,VIP+0):谢谢。2个yes，2个no的情况下，一般也是Normal termination，但是没有显示Optimization completed，只显示了Optimization completed on the basis of negligible forces。而只有4个yes的情况下才显示Optimization completed。请问这样可以吗？呵呵。 4-23 09:22
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 4-24 19:28
龙之心(金币+2,VIP+0):谢谢。2个yes，2个no的情况下，一般也是Normal termination，但是没有显示Optimization completed，只显示了Optimization completed on the basis of negligible forces。而只有4个yes的情况下才显示Optimization completed。请问这样可以吗？呵呵。 4-23 09:22
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 4-24 19:28
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在优化结构的时候是要求四个收敛标准都要达到的。否则文件也不会正常结束。 而在计算频率的时候，出现前两个收敛标准yes后两个收敛标准no的情况文件也能够正常结束。只要文件是正常结束的，我觉得就应该是计算成功，可以进行后续工作，不必再此多纠缠。 |
7楼2009-04-22 22:40:02
8楼2009-05-11 10:31:48