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虫子739

铁虫 (小有名气)

[交流] 内参引物设计

由于不知道苔藓的那几种内参的序列,就用其他几种植物比较设计的内参引物,设计了三对,actin,tublin和18S。pcr结果很差,要么没条带,要么条带很淡。请问高手,你们在遇到这种情况的时候,是怎么设计出高质量的内参的?谢谢!
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虫子739

铁虫 (小有名气)

谢谢!~我就是这样设计的,可是PCR效果很差!也许是小片段的PCR条件还不合适,也许是选择的几个物种差异太大,没找到合适的保守区。总之,结果不尽人意
5楼2009-04-29 16:13:11
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香菱儿

铁杆木虫 (著名写手)

根据保守区重新设计引物
漫洒英雄泪,相离处士家。谢慈悲剃度在莲台下。没缘法转眼分离乍。赤条条来去无牵挂。那里讨烟蓑雨笠卷单行?一任俺芒鞋破钵随缘化!
2楼2009-04-17 13:37:10
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虫子739

铁虫 (小有名气)

请问怎样才能知道这个基因的保守区?
3楼2009-04-17 17:31:42
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chuan2388

金虫 (小有名气)

先在genebank中找到情缘相近的物种的基因序列,对这些序列做clast,于是就可以找到保守性强的区域,根据保守序列就可以设计出通用引物,p出包含你要的基因序列,再通过测序后设计新的引物,从而就可以p出你要的基因序列了。
把时间都浪费在自己身上吧!
4楼2009-04-20 21:18:21
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