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[交流]
【求助】MS进行能量最小化后如何输出晶体中各原子的坐标
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如题，本人刚接触MS，想问各位大牛，如何将原子坐标输出？ 我试了File下Export命令，但是里面没有对应的文件后缀。 请问，有什么好的方法可以解决，最好输出mol格式的文件。 [ Last edited by freshgirl on 2009-6-21 at 17:04 ] |
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3楼2009-04-16 22:40:21
2楼2009-04-16 22:34:09
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linlin1011(金币+1,VIP+0):thanks a lot. 4-16 22:54
linlin1011(金币+1,VIP+0):thanks a lot. 4-16 22:54
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我又试了一下，你可以先保存成PDB格式，然后用记事本打开这个文件，可以得到晶格格矢的长度和格矢间的夹角，以及相对坐标。 一个例子如下 CRYST1 10.000 10.000 10.000 90.00 90.00 90.00 PM-3M ATOM 1 Mn MOL 2 0.000 0.000 0.000 1.00 0.00 Mn ATOM 2 Ga MOL 2 0.000 5.000 0.000 1.00 0.00 Ga ATOM 3 Mn MOL 2 0.000 5.000 5.000 1.00 0.00 Mn ATOM 4 Ni MOL 2 5.000 5.000 5.000 1.00 0.00 Ni ATOM 5 Ni MOL 2 2.500 2.500 2.500 1.00 0.00 Ni |
4楼2009-04-16 22:48:04
vbaov
木虫 (著名写手)
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5楼2009-04-17 11:07:49