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dcb005

金虫 (著名写手)

[交流] 西红柿 成熟果实RNA提取

前段时间用trizol 法提取西红柿成熟果实RNA,结果没有提出来,提了好多次都没有,不知道为什么?并且有大量的白色胶状沉淀。虫友们有没有好的提取果实RNA的方法?
★穷则独善其身,达则兼济天下★
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yuegh

铁杆木虫 (职业作家)

RNA比DNA容易降解多了,确定那是RNA吗
CTAB可以用于从大量产生粘多糖的有机体如植物以及某些革兰氏阴性菌(包括E.coli的某些株)中制备纯化DNA 。
个人认为在第一步加入蛋白酶K时可同时加入RNase 以降解RNA

CTAB法原理    CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)是一种阳离子去污剂,具有从低离子强度溶液中沉淀核酸与酸性多聚糖的特性。在高离子强度的溶液中(>0.7mol/L NaCl),CTAB与蛋白质和多聚糖形成复合物,只是不能沉淀核酸。通过有机溶剂抽提,去除蛋白,多糖,酚类等杂质后加入乙醇沉淀即可使核酸分离出来。

CTAB提取缓冲液的经典配方
Tris-HCl (pH8.0)提供一个缓冲环境,防止核酸被破坏;
EDTA螯合Mg2+或Mn2+离子,抑制DNase活性;
NaCl 提供一个高盐环境,使DNA充分溶解,在于液相中;                               CTAB溶解细胞膜,并结合核酸,使核酸便于分离;
β-巯基乙醇是抗氧化剂,有效地防止酚氧化成醌,避免褐变,使酚容易去除
PVP(聚乙烯吡咯烷酮)是酚的络合物,能与多酚形成一种不溶的络合物质,有效去除多酚,减少DNA中酚的污染;同时它也能和多糖结合,有效去除多糖。   
  
用乙醇沉淀DNA时,通常要在溶液中加入单价的阳离子,如NaCl 或 NaAc,Na+中和DNA分子上的负电荷,减少DNA分子之间的同性电荷相斥力,而易于聚集沉淀。
3楼2009-04-15 11:10:10
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gzsjls

木虫 (职业作家)

纯纯家族之纯火星

2楼2009-04-15 11:05:46
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