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Harusame97

新虫 (初入文坛)

[求助] Quantum Espresso dat文件转换出错

我使用的QE版本是6.3 工作环境是Ubuntu16+Intel MPI(并行环境已经识别,QE计算没有报错)
我需要把/outdir/.save中的dat波函数文件转换成可读格式
但在调用iotk时报错,内容如下:

iotk: using ./../bin/iotk.x executable
############################################################################################################
# FROM IOTK LIBRARY, VERSION 1.2.0
# UNRECOVERABLE ERROR (ierr=1)
# ERROR IN: iotk_tag_parse (iotk_misc.f90:999)
# CVS Revision: 1.39
# Wrong syntax in tag
tag= z�����
             z��
# ERROR IN: iotk_open_read (iotk_files.f90:639)
# CVS Revision: 1.20
#############################################################################################################
Attempting to use an MPI routine before initializing MPICH

实在不知道该怎么fix,折腾了整整两天快崩溃了,求救!!
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zhufengjuan

铁杆木虫 (文坛精英)

wmly
2楼2018-11-10 06:42:45
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漫天飘雪

版主 (知名作家)

认真做事,踏实做人

应该并行处理
http://blog.sciencenet.cn/u/pfliu89
3楼2018-11-10 09:02:45
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Harusame97

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 漫天飘雪 at 2018-11-10 09:02:45
应该并行处理

调用mpirun -np 4得到的结果就是报了4遍同样的错_(:з)∠)_,大概不是这样的原因
4楼2018-11-10 09:07:36
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漫天飘雪

版主 (知名作家)

认真做事,踏实做人

引用回帖:
4楼: Originally posted by Harusame97 at 2018-11-10 09:07:36
调用mpirun -np 4得到的结果就是报了4遍同样的错_(:з)∠)_,大概不是这样的原因...

这错误我也遇见过,并行应该没处理好。后来我用了串行的,好像解决了,你可以试试。pw.x 也是串行
http://blog.sciencenet.cn/u/pfliu89
5楼2018-11-10 09:24:58
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Harusame97

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 漫天飘雪 at 2018-11-10 09:24:58
这错误我也遇见过,并行应该没处理好。后来我用了串行的,好像解决了,你可以试试。pw.x 也是串行...

串行也不行,我在笔记本上部署了串行版,一个毛病
6楼2018-11-10 09:37:49
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漫天飘雪

版主 (知名作家)

认真做事,踏实做人

引用回帖:
6楼: Originally posted by Harusame97 at 2018-11-10 09:37:49
串行也不行,我在笔记本上部署了串行版,一个毛病...

换个版本吧,我也没啥好建议了
http://blog.sciencenet.cn/u/pfliu89
7楼2018-11-10 09:52:41
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Harusame97

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 漫天飘雪 at 2018-11-10 09:52:41
换个版本吧,我也没啥好建议了...

哥,谢谢你...又折腾了13个小时没弄好,我一口气降了两个版本号到6.1
完美结局。。。并行和iotk都可以用了,看来是QE6.3的iotk有问题
检查了6.3的iotk输出的dat文件确实也不全
8楼2018-11-10 14:07:29
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