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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » QE(Pwscf) » Quantum Espresso dat文件转换出错
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Harusame97

新虫 (初入文坛)

[求助] Quantum Espresso dat文件转换出错

我使用的QE版本是6.3 工作环境是Ubuntu16+Intel MPI（并行环境已经识别，QE计算没有报错）
我需要把/outdir/.save中的dat波函数文件转换成可读格式
但在调用iotk时报错，内容如下：

iotk: using ./../bin/iotk.x executable
############################################################################################################
# FROM IOTK LIBRARY, VERSION 1.2.0
# UNRECOVERABLE ERROR (ierr=1)
# ERROR IN: iotk_tag_parse (iotk_misc.f90:999)
# CVS Revision: 1.39
# Wrong syntax in tag
tag= z�����
             z��
# ERROR IN: iotk_open_read (iotk_files.f90:639)
# CVS Revision: 1.20
#############################################################################################################
Attempting to use an MPI routine before initializing MPICH

实在不知道该怎么fix，折腾了整整两天快崩溃了，求救！！
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1楼 2018-11-10 03:07:13
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zhufengjuan

铁杆木虫 (文坛精英)
tfboys

发自小木虫Android客户端
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wmly
2楼2018-11-10 06:42:45
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漫天飘雪

版主 (知名作家)

认真做事，踏实做人
应该并行处理
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http://blog.sciencenet.cn/u/pfliu89
3楼2018-11-10 09:02:45
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Harusame97

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 漫天飘雪 at 2018-11-10 09:02:45
应该并行处理

调用mpirun -np 4得到的结果就是报了4遍同样的错_(:з)∠)_，大概不是这样的原因
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4楼2018-11-10 09:07:36
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漫天飘雪

版主 (知名作家)

认真做事，踏实做人
引用回帖:
4楼: Originally posted by Harusame97 at 2018-11-10 09:07:36
调用mpirun -np 4得到的结果就是报了4遍同样的错_(:з)∠)_，大概不是这样的原因...

这错误我也遇见过，并行应该没处理好。后来我用了串行的，好像解决了，你可以试试。pw.x 也是串行
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http://blog.sciencenet.cn/u/pfliu89
5楼2018-11-10 09:24:58
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Harusame97

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 漫天飘雪 at 2018-11-10 09:24:58
这错误我也遇见过，并行应该没处理好。后来我用了串行的，好像解决了，你可以试试。pw.x 也是串行...

串行也不行，我在笔记本上部署了串行版，一个毛病
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6楼2018-11-10 09:37:49
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漫天飘雪

版主 (知名作家)

认真做事，踏实做人
引用回帖:
6楼: Originally posted by Harusame97 at 2018-11-10 09:37:49
串行也不行，我在笔记本上部署了串行版，一个毛病...

换个版本吧，我也没啥好建议了
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http://blog.sciencenet.cn/u/pfliu89
7楼2018-11-10 09:52:41
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Harusame97

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 漫天飘雪 at 2018-11-10 09:52:41
换个版本吧，我也没啥好建议了...

哥，谢谢你...又折腾了13个小时没弄好，我一口气降了两个版本号到6.1
完美结局。。。并行和iotk都可以用了，看来是QE6.3的iotk有问题
检查了6.3的iotk输出的dat文件确实也不全
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8楼2018-11-10 14:07:29
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