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楼1970-01-01 08:00:00
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minmin_0082003

金虫 (正式写手)

莫愁莫愁
Population analysis using the SCF density.

**********************************************************************

Orbital symmetries:
       Occupied  (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
       Virtual   (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A)
The electronic state is 1-A.
Alpha  occ. eigenvalues --   -3.07502  -1.89558  -1.89108  -1.84306  -0.73178
Alpha  occ. eigenvalues --   -0.67547  -0.67168  -0.41982  -0.41498  -0.41403
Alpha  occ. eigenvalues --   -0.41284  -0.38628  -0.32313  -0.32292  -0.28156
Alpha  occ. eigenvalues --   -0.28045  -0.22906  -0.22514  -0.19750  -0.18774
Alpha virt. eigenvalues --   -0.10058  -0.01571  -0.00496   0.00175   0.03679
Alpha virt. eigenvalues --    0.04089   0.04320   0.04870   0.05728   0.12519
Alpha virt. eigenvalues --    0.14648   0.17367   0.18346   0.24597   0.32794
Alpha virt. eigenvalues --    0.34681   0.35365   0.36877   0.37029   0.37526
Alpha virt. eigenvalues --    0.39747   0.40176   0.41842   0.42984   0.44009
Alpha virt. eigenvalues --    0.48428   0.54138   0.55755   0.57476   0.59109
Alpha virt. eigenvalues --    0.60811   0.61055   0.61990   0.70763   0.73115
Alpha virt. eigenvalues --    0.73262   0.73939   0.76536   0.82318   0.84438
Alpha virt. eigenvalues --    0.87341   0.88660   0.91677   0.96358   0.96680
Alpha virt. eigenvalues --    1.12107   1.12214   1.13618   1.14705   3.07854
Alpha virt. eigenvalues --    8.80442  11.99276  14.35468   
          Condensed to atoms (all electrons):
              1          2          3          4          5          6
     1  Rh  16.500493   0.205139   0.161879  -0.009434  -0.009336  -0.005503
     2  Cl   0.205139   7.126911  -0.001735  -0.001039  -0.001010   0.000324
     3  P    0.161879  -0.001735   4.072983   0.353886   0.353647   0.335792
     4  H   -0.009434  -0.001039   0.353886   0.544565  -0.019881  -0.016786
     5  H   -0.009336  -0.001010   0.353647  -0.019881   0.545180  -0.016814
     6  H   -0.005503   0.000324   0.335792  -0.016786  -0.016814   0.593185
     7  P    0.161918  -0.001746  -0.023018   0.000057   0.000057   0.000055
     8  H   -0.005500   0.000326   0.000055   0.000000   0.000000   0.000000
     9  H   -0.009340  -0.001013   0.000057   0.000000  -0.000001   0.000000
    10  H   -0.009440  -0.001045   0.000057  -0.000001   0.000000   0.000000
              7          8          9         10
     1  Rh   0.161918  -0.005500  -0.009340  -0.009440
     2  Cl  -0.001746   0.000326  -0.001013  -0.001045
     3  P   -0.023018   0.000055   0.000057   0.000057
     4  H    0.000057   0.000000   0.000000  -0.000001
     5  H    0.000057   0.000000  -0.000001   0.000000
     6  H    0.000055   0.000000   0.000000   0.000000
     7  P    4.072870   0.335764   0.353659   0.353893
     8  H    0.335764   0.593232  -0.016813  -0.016782
     9  H    0.353659  -0.016813   0.545165  -0.019881
    10  H    0.353893  -0.016782  -0.019881   0.544523
那这个是不是普通的分析
我是在论文中看到有人做布局分析来确定是否成键，以及成键的程度，分析成键的时候大部分是这样说的“1与2的键逐渐形成，布局数增加”
举一个论文上的例子
是各个中间态的成键的重叠布局数。原子Co跟C之间的
          R1          TS1-2      R2             R3        TS3-4      R4
Co-C   ~            ~         0.0945       0.1463 0.3159         0.1216

我想知道的就是这几个数据到底是输出文件的哪些个呢？？？
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8楼2009-04-28 10:24:07
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wzpwzp

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 4-20 17:17
简单通俗地说，重叠布居的大小可以说明原子间结合力度大小，值越大，结合力越大。（当然，从布居电荷角度讲，又可利用它说明体系的微观反应活性）
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2楼2009-04-14 08:32:24
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minmin_0082003

金虫 (正式写手)

莫愁莫愁
那从输出文件里面那一部分是呢，又该怎么分析呢
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3楼2009-04-14 17:00:44
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wzpwzp

金虫 (小有名气)
★ ★
loovfnd(金币+2,VIP+0):能更具体吗？会有更多惊喜！ 4-24 16:52
输出文件好象在总能量(Total Eergy)的结果之后；电荷数的前面。如果体系较大，输出文件会篇幅很大，那就要弄清原子编号，然后对应地自己找到您想知道的两个原子间的布居数。
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4楼2009-04-24 16:40:38
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