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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】从PDB搜索出很多结果，怎么选择？
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zengll

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】从PDB搜索出很多结果，怎么选择？

我做的是DPP-IV抑制剂，在PDB中搜索出很多个蛋白，请问为什么会有这样的结果？我该如何选择？

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 21:36 ]
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1楼 2009-04-11 21:26:51
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)
★
mingdong(金币+1,VIP+0):谢谢！ 4-12 13:53
选择A小的值，分辨率高。另外用高活性抑制剂的晶体结构。
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除了你的亲人，没有人应该对你好，对你好的人，一定要珍惜。
2楼2009-04-11 22:13:43
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nh13

木虫 (正式写手)
★ ★
mingdong(金币+2,VIP+0):谢谢！ 4-16 17:54
1.分辨率高的
2.最好是人源的吧
3.配体与你的作用靶点类似的吧
4.文献较新的

感觉还是多试几个比较好吧。
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3楼2009-04-16 14:00:29
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杞实很简单

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★
mingdong(金币+2,VIP+0):谢谢！ 4-28 07:01
分辨率高的；
做蛋白晶体的团队够有地位；
从他的修改更新日期可以看出晶体在不断完善的。
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4楼2009-04-27 16:40:02
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xuxm03

金虫 (小有名气)
★ ★
mingdong(金币+2,VIP+0):谢谢！ 4-28 07:02
根据结晶这个蛋白的文献报道，恰当选择。
读一下人家解析蛋白的那个文章，对你的工作很有帮助，不要仅仅局限于结构
当然分辨率高的比较好
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5楼2009-04-27 21:38:28
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wendaoliuxu

捐助贵宾 (小有名气)

分辨率

★ ★
mingdong(金币+2,VIP+0):感谢回复！ 6-10 07:05
分辨率是王道；
源自哪个科研团队，文献级别；
考虑靶点；
实在不舍得其中一些，分点给毕业设计或者小师弟师妹…… (*^__^*) 嘻嘻……
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whowantstobemy"ErwinSchrodinger'sCat"?
6楼2009-06-01 13:33:21
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