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MD 平面膜模拟，各向异性的问题
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MD仿真，对于平面膜的模拟（长方体盒结构，粗粒化模型），mdp文件参数如下： Tcoupl = Berendsen tc_grps =DPPC Protein PW_ION tau_t = 1.0 1.0 1.0 ref_t = 310 310 310 Pcoupl = Berendsen pcoupltype = semiisotropic tau_p = 0.2 0.2 compressibility = 3e-5 3e-5 ref_p = 1.0 1.0 未加入电场时，能够正常的运行；加入电场后，盒子变矮变宽，并报错中断，如下： Fatal error: The Z-size of the box (15.861096) times the triclinic skew factor (1.000000) is smaller than the number of DD cells (12) times the smallest allowed cell size (1.321887) 网上说是减少并行核数，但是没啥用，我觉得可能是参数设置问题导致系统不够稳定，希望大神能帮忙看下。（附件是整个mdp文件） |
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