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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 【求助】做表面吸附时的分子结构优化问题
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pollyan

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】做表面吸附时的分子结构优化问题

请问，做吸附时，吸附分子和晶体都必须在MS中直接优化吗？
我做的吸附分子是有机物，有四五十个原子，而且是设计出的新物质，没有现成的数据可查，我应该在gaussian中优化后再导入MS？还是必须直接都在MS中优化呢？
请大家指点，谢谢！

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-21 at 17:10 ]
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玻璃眼
1楼 2009-04-10 17:33:08
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pollyan

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by spur at 2009-4-12 15:56:

其实castep计算的能力实在不敢恭维。建议你先用castep优化吸附分子，当然如果能用gaussian优化，当然最好。然后再估算下－比如用单原子算一下吸附位置、距离载体的距离，最后再在此基础上将分子放上去。

因为我的分子构型也是不知道的，所以我就想用Gaussian优化它，然后在用Castep去算吸附，如果这样的话，吸附分子优化采用的算法肯定和晶体不一样，而且算完吸附构型后必将与吸附分子的初始构型进行比较，这二者也是不同的算法，这样能行吗？

[ Last edited by pollyan on 2009-4-12 at 22:33 ]
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玻璃眼
7楼2009-04-12 16:35:03
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zxzj05

荣誉版主 (著名写手)
★ ★
zdhlover(金币+2,VIP+0):谢谢 4-11 01:00
分别优化，放到一起再优化一次
不一定都要在MS，能用同一个方法优化当然最好了，写文章时候比较好描述
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储氢家族欢迎储氢研究者！
2楼2009-04-10 18:14:06
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pollyan

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by zxzj05 at 2009-4-10 18:14:
分别优化，放到一起再优化一次
不一定都要在MS，能用同一个方法优化当然最好了，写文章时候比较好描述

谢谢斑竹指导
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玻璃眼
3楼2009-04-10 20:49:20
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s638638

铁虫 (小有名气)
★ ★
spur(金币+2,VIP+0): 3Q！！谢谢参与！欢迎常来！ 4-11 09:34
你的吸附分子那么大的话，可能会有问题哦，不知你用什么模块，吸附分子的构象，吸附位置，吸附点都需要考虑的
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4楼2009-04-10 22:04:45
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