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mercypang

金虫 (小有名气)

[求助] 请问基因测序中的RPKM值可以比较不同基因间的丰度吗？ 已有1人参与

请问基因测序中的RPKM值可以比较不同基因间的丰度吗？
比如，同一个试验中测了11中组织中的某些基因，可以用RPKM比较基因A在不同组织中的含量的多少及基因A与其他基因在同一个组织中的多少吗？
谢谢
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1楼 2018-10-15 03:20:09
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drwhoknowss

荣誉版主 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2018-10-15 07:50:16
1. 基因A在不同组织中的含量的多少. 这个没问题，基本是RNA-seq之类试验的标准答案。
2. 基因A与其他基因在同一个组织中的多少。这个智者见智，仁者见仁。每个基因功能不同，调控不同，需要的量不同，风牛马不相及。我的看法是比较起来没有意义。英文的表达是：You can't compare apple to orange.
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Progress in science depends on new techniques, new discoveries and new ideas, probably in that order. -- Nobel laureate Sydney Brenner
2楼2018-10-15 03:34:08
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