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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 小小金币求解"氢无受体"
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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gongyunnan

木虫 (小有名气)

[交流] 小小金币求解"氢无受体"

因为在LST文件中有以下Alternative,不知道如何处理,没加氢键故H3W无受体.不知道应该如何处理,请教大家了;

O8-H3W         0.668
------------------------------------------------------------------------------
Alternative approximate positions for H attached to O8:
   0.4154  0.4629  0.6328  O..O7   2.844      0.4663  0.4608  0.7500  O..O3 [ -x+1, y-1/2, -z+3/2 ]  3.016      0.4534  0.5185  0.7507  O..O4 [ x, -y+3/2, z+1/2 ]  3.021      0.4965  0.4966  0.5863  O..O8 [ -x+1, -y+1, -z+1 ]  3.144      0.3961  0.5102  0.6381  O..O1   3.364   ------------------------------------------------------------------------------
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1楼 2009-04-08 22:21:01
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zqfkkd

铁杆木虫 (正式写手)
★
waiy2001(金币+1,VIP+0):谢谢参与讨论 4-9 08:33
这个单从你给的数据不好判断。因为你也没给出O8的具体位置。单从键长键角来判断，我倾向于第一和第四个，最后一个距离貌似远了点。
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2楼2009-04-09 07:31:15
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mengxianggao

木虫 (正式写手)

新手
★
waiy2001(金币+1,VIP+0):3qs 4-9 08:33
用platon计算一下，看看能否找到比较合适的位置。
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新手学习
3楼2009-04-09 07:43:57
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★
lingzi326(金币+1,VIP+0):谢谢建议 4-9 09:48
按lst的建议改一下试试.
但最后要通过checkcif, 看看所加的氢之间有没有相互距离太近了的.
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xi2004-emuch@163.com
4楼2009-04-09 08:44:33
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paopaomeng

铁杆木虫 (著名写手)
★
洛阳学子(金币+1,VIP+0):谢谢 4-11 23:40
有没有可能是由于空间位堵导致就是没有合适的受体呢？
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经历了“删除门”，有点晕！
5楼2009-04-09 18:08:47
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alusia

金虫 (正式写手)
★ ★
洛阳学子(金币+1,VIP+0):回复认真 4-11 23:41
gongyunnan(金币+1,VIP+0): 4-19 10:04
严格的说，这个H不管加在哪里都不是真实的H，目的仅仅是为了实现化学结构上的合理。你可以把软件建议的那几个H的位置手工加到INS文件中去，然后计算。如果加上去以后合理，并且没有和其他H形成冲突就可以了。加H还是比较费时间的，有时情况复杂的话，一个H可以让人搞好几个小时。还不一定能搞定。
实在不行可以上RES文件和HKL文件帮你看看。不过如果你数据急用就帮不上忙了。
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思念
6楼2009-04-11 22:18:54
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