24小时热门版块排行榜    

查看: 449  |  回复: 2
当前主题已经存档。

goalry

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助完毕】

请教一下分子动力学中的控温和控压的几种算法,他们的原理是什么?

1. 控温的:速度标定(velocity re-scaling algorithm )方法
2. 调压方法:Andersen's algorithm 和体积标定(volume rescaling algorithm )。

谁有以上三中方法的资料介绍,非常感谢能共享一下!!

[ Last edited by zdhlover on 2009-11-22 at 13:19 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

君子以自强不息,厚德载物
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

superdirac

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
goalry(金币+5,VIP+0):谢谢!! 4-9 22:20
goalry(金币+1,VIP+0):谢谢参与! 4-9 22:34
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 4-20 18:55
temperature control

  1)velocity re-scaling algorithm
    这种方法很不好! 现在几乎不用了!
 一般用nose-hoover ,andersion
      2)nose-hoover thermost:
            molecualr physics 1984,vol.52.No,2.255-268;A molecular dynamics method for simulations in the canonical ensemble
      3)anderson thermost
   这三种方法都可以在 
  understanding molecular simulation _ from algorithms to application
         frenkel and smit  P:        139页找到!

pressure control

1)langevin
”Constant pressure molecular dynamics algorithms”, J. Chem. Phys 101(5), 1994,

piston fluctuation controlimplemented using Langevin dynamics as in SE Feller, Y Zhang, RW Pastor and BR Brooks,

”Constant pressure molecular dynamics simulation: The Langevin piston method”, J. Chem. Phys.103(11), 1995.
2) volume rescaling methods !我觉得和 nose-hoover 压力浴时一致的
3) anderson   methoud (week coupling method) 也anderson 热浴原理一致. 在那本书给出的参考文献列表里应该有.



其实,温度和压力控制的原理几乎一直,只是控制的物理量不一致.

[ Last edited by superdirac on 2009-4-8 at 22:28 ]
我认为,酒一口一口喝,路一步一步走~步子迈大了,喀~容易扯着蛋
2楼2009-04-08 22:18:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tianlangxingaa

铁杆木虫 (著名写手)

温度控制。

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
goalry(金币+5,VIP+0):谢谢!! 4-9 22:22
goalry(金币+1,VIP+0):谢谢参与! 4-9 22:34
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 4-20 18:56
一般都是用thermostat来控制温度,楼上说的对,NS热浴,和Brendsen热于都可以,后者更好点。但是现在流行的是一个Langevin热于+MD势函数,还可以用LA热于,不过各有各的长处,我倾向用Langevin热于,呵呵,具体可以参考DPD方法。

完毕
3楼2009-04-08 23:00:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 goalry 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 化学工程321分求调剂 +9 大米饭! 2026-03-15 12/600 2026-03-16 21:59 by 大米饭!
[考研] 药学383 求调剂 +3 药学chy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 20:51 by 元子^0^
[考研] 302求调剂 +3 小贾同学123 2026-03-15 5/250 2026-03-16 20:39 by zhq0425
[考研] 化学调剂0703 +8 啊我我的 2026-03-11 8/400 2026-03-16 17:23 by 我的船我的海
[考研] 085600调剂 +5 漾漾123sun 2026-03-12 6/300 2026-03-16 15:58 by 漾漾123sun
[考研] 一志愿华中师范071000,325求调剂 +6 RuitingC 2026-03-12 6/300 2026-03-16 14:50 by 可淡不可忘
[考研] 中科大材料与化工319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:10 by ms629
[考研] 290求调剂 +4 @将就将就看 2026-03-10 8/400 2026-03-14 14:23 by 千千运气
[考研] 297求调剂 +4 学海漂泊 2026-03-13 4/200 2026-03-14 11:51 by 热情沙漠
[考研] 330求调剂 +3 ?酱给调剂跪了 2026-03-13 3/150 2026-03-14 10:13 by JourneyLucky
[考研] 0703求调剂 +7 jtyq001 2026-03-10 7/350 2026-03-14 01:06 by JourneyLucky
[考研] 0703,333分求调剂 一志愿郑州大学-物理化学 +3 李魔女斗篷 2026-03-11 3/150 2026-03-13 22:24 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西南交大,材料专硕317求调剂 +5 lx8568 2026-03-11 5/250 2026-03-13 21:43 by peike
[考研] 四川大学085601材料工程专硕 初试294求调剂 +4 祝我们好在冬天 2026-03-11 4/200 2026-03-13 21:39 by peike
[考研] 【考研调剂求收留】 +3 Ceciilia 2026-03-11 3/150 2026-03-13 20:18 by JourneyLucky
[考研] 一志愿211化学学硕310分求调剂 +8 努力奋斗112 2026-03-12 9/450 2026-03-13 15:41 by JourneyLucky
[论文投稿] 投稿问题 5+4 星光灿烂xt 2026-03-12 6/300 2026-03-13 14:17 by god_tian
[考研] 277求调剂 +4 anchor17 2026-03-12 4/200 2026-03-13 11:15 by 白夜悠长
[考研] 321求调剂(食品/专硕) +3 xc321 2026-03-12 6/300 2026-03-13 08:45 by xc321
[考博] 26申博求助 +3 跳跃饼干 2026-03-10 4/200 2026-03-10 21:15 by Tntcnn
信息提示
请填处理意见