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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【分享】【求助】DS中怎么整体最小化
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xiao2008zhu

银虫 (小有名气)

[交流] 【分享】【求助】DS中怎么整体最小化

在DS中，自己画了两个分子，在安排力场以后，进行最小化，可是每次只能最小化一个分子，如何两个分子整体最小化？谢谢了。

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 12:24 ]
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1楼 2009-04-08 20:19:00
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PSA

专家顾问 (著名写手)
★
xuefei06(金币+1,VIP+0):感谢你的参与！ 4-18 22:30
将两个分子放在一个3D window里就可以了吧
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2楼2009-04-18 15:20:13
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童心

木虫 (正式写手)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 8-9 22:38
只能分开优化，因为你选优化的时候就只能选一个，所以不管你是放一个窗口还是两个窗口，都没用的
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3楼2009-08-09 21:45:18
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arthurii

木虫 (正式写手)
★ ★
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lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 8-14 10:33
DS有一个开发工具，应该可以在里面编一个流程，我还没试过。
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4楼2009-08-14 10:05:13
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arthurii

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+2,VIP+0):thanks 8-25 21:32
可以一起做了，方法是把两个小分子的chain放到一个分子里面。但是两个分子得拉开点，不是就相互作用了……
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5楼2009-08-25 21:16:50
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童心

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
放在一个分子下面是可以做，但是是否考虑到两个之间会相互影响了？这样的结果是否与单独优化不一样？我没做过，提出这个疑问而已，而且我觉得没必要同时优化两个，毕竟时间上面又不节约。
引用回帖:
Originally posted by arthurii at 2009-8-25 21:16:
可以一起做了，方法是把两个小分子的chain放到一个分子里面。但是两个分子得拉开点，不是就相互作用了……

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6楼2009-08-30 11:56:52
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arthurii

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 童心 at 2009-8-30 11:56:
放在一个分子下面是可以做，但是是否考虑到两个之间会相互影响了？这样的结果是否与单独优化不一样？我没做过，提出这个疑问而已，而且我觉得没必要同时优化两个，毕竟时间上面又不节约。


我也这样觉得，只是如果真的硬要两个同时的话，就只想到这种方法
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7楼2009-08-30 12:44:47
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