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关于分析对接结果
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请教, 1. 我用auto dock做了酶和我(R)(S)底物对接,我旨在提高(S)立体选择性。该怎么分析两者对接结果? 2. 对接出来的结果,我想测量成键距离,已成键的用DS直接显示距离,那么如果分析出来其他的范德华力并没有成键啊,但我想测下距离,测哪个原子到哪个原子的距离,还是,酶上氨基酸残基最外枝 的原子和最靠近的底物原子的距离? 3. 大神们有没有好看的pymol作图经验,求发一份,上网找了好多,老板觉得并不完美 |
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