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小福包56

新虫 (初入文坛)

[求助] 使用autodock观察对接好的分子构象到时候遇到了问题,跪求解答

如题所示,在使用autogrid与autodock之后生成了.dlg文件,记事本打开该文件显示已经成功successful completion成功完成了。
通过analyze→docking→open读取.dlg文件的时候也没有出现bug。但是随后通过analyze→conformation→load观察对接好的分子构象的时候突然就报错了,报错内容如下:
Exception in Tkinter callback
Traceback (most recent call last):
  File "F:\MGTtools\install\lib\lib-tk\Tkinter.py", line 1403, in __call__
    return self.func(*args)
  File "F:\MGTtools\install\lib\site-packages\AutoDockTools\autoanalyzeCommands.py", line 4124, in showConf
    mol = self.vf.Mols.NodesFromName(name)[0]
  File "F:\MGTtools\install\lib\UserList.py", line 28, in __getitem__
    def __getitem__(self, i): return self.data
IndexError: list index out of range
但是也是可以看到具体的构象的样子的,不明白发生了什么。希望各路大神予以解答!!万分感激!!
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向世界伸出圆手
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longdlut

捐助贵宾 (著名写手)


2楼2018-09-03 17:55:06
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小福包56

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by longdlut at 2018-09-03 17:55:06
重启软件试试

我有试过但是还是不行,一点击load总是出故障
向世界伸出圆手
3楼2018-09-03 19:24:51
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蓉蓉药化

新虫 (初入文坛)

可能是少了步骤。打开的dlg是配体,可能你没有选择受体。按步骤来,后面的一步也不能省,就可以的。百度上有简易步骤和中文步骤,试试看

发自小木虫Android客户端
4楼2018-10-02 01:07:24
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cngdkpmg

铁虫 (小有名气)

这就是我不愿意用MGLTools的原因,用的时候各种问题,还很无厘头。建议楼主用殷赋云计算平台啊(http://www.yinfotek.com/platform),不用安装软件,全部在浏览器上完成,非常便捷简单,功能又强大。
5楼2019-03-25 12:17:36
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