| 查看: 1827 | 回复: 10 | ||||
[交流]
lammps的输入data文件怎么样才能包含键位信息？
|
||||
|
请问一下各位大神，我在lammps里面想使用morse势函数，例如 bond_style morse bond_coeff 5 1.0 2.0 1.2 我的输入文件是从MS导出的pdb文件，然后用VMD转化成的data文件， 可是发现里面不含键的信息，请问一下data文件怎么样才能包含键位信息和原子信息？ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 分子动力学-初级问题资源 |
» 猜你喜欢
有多少人是今天查系统知道结果的？
已经有19人回复
-
面上合作单位盖章
已经有9人回复
-
面上函评意见出来了，像什么等级？
已经有17人回复
-
为什么国自然不能直接公布
已经有5人回复
-
梦想
已经有7人回复
-
学科评审组评审是指会评吗？
已经有4人回复
-
为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难
已经有14人回复
-
小白求助 投论文要求的highlights应该如何写
已经有4人回复
-
麻烦专家们看看评委们的意见（F口面上）
已经有12人回复
-
怎么看青基中了没有啊
已经有6人回复
2楼2018-08-31 09:30:57
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
|
包含不了，msi2lmp作者已停止更新，并且缺少很多种键型数据，转换时最多只能保证键、键角、二面角的位置，键能、长、键角信息需要你参考文献，自己手动输入，在使用时加入-ignore参数你就可以自己输入，注意删除转换后data文件中的lj/cut/coul/long力场信息 发自小木虫Android客户端 |
8楼2018-08-31 12:02:02
9楼2019-04-02 19:57:07
10楼2019-04-02 23:12:52
11楼2020-03-10 06:36:26
简单回复
nono20093楼
2018-08-31 09:30
回复
举重若轻I(金币+1): 谢谢参与
·
tzynew4楼
2018-08-31 09:43
回复
举重若轻I(金币+1): 谢谢参与
tableman5楼
2018-08-31 10:43
回复
举重若轻I(金币+1): 谢谢参与
2018-08-31 11:51
回复
举重若轻I(金币+1): 谢谢参与
youngen7楼
2018-08-31 12:00
回复
举重若轻I(金币+1): 谢谢参与
投票:
5