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[交流]
lammps的输入data文件怎么样才能包含键位信息?
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请问一下各位大神,我在lammps里面想使用morse势函数,例如 bond_style morse bond_coeff 5 1.0 2.0 1.2 我的输入文件是从MS导出的pdb文件,然后用VMD转化成的data文件, 可是发现里面不含键的信息,请问一下data文件怎么样才能包含键位信息和原子信息? |
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2楼2018-08-31 09:30:57
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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包含不了,msi2lmp作者已停止更新,并且缺少很多种键型数据,转换时最多只能保证键、键角、二面角的位置,键能、长、键角信息需要你参考文献,自己手动输入,在使用时加入-ignore参数你就可以自己输入,注意删除转换后data文件中的lj/cut/coul/long力场信息 发自小木虫Android客户端 |
8楼2018-08-31 12:02:02
9楼2019-04-02 19:57:07
10楼2019-04-02 23:12:52
11楼2020-03-10 06:36:26
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nono20093楼
2018-08-31 09:30
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tzynew4楼
2018-08-31 09:43
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tableman5楼
2018-08-31 10:43
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2018-08-31 11:51
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youngen7楼
2018-08-31 12:00
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