| 查看: 1613 | 回复: 10 | ||||
[交流]
lammps的输入data文件怎么样才能包含键位信息?
|
||||
|
请问一下各位大神,我在lammps里面想使用morse势函数,例如 bond_style morse bond_coeff 5 1.0 2.0 1.2 我的输入文件是从MS导出的pdb文件,然后用VMD转化成的data文件, 可是发现里面不含键的信息,请问一下data文件怎么样才能包含键位信息和原子信息? |
» 收录本帖的淘帖专辑推荐
分子动力学-初级问题资源 |
» 猜你喜欢
一志愿华中师范071000,325求调剂
已经有6人回复
070303一志愿西北大学学硕310找调剂
已经有6人回复
311求调剂
已经有4人回复
0703化学调剂
已经有8人回复
070303 总分349求调剂
已经有5人回复
309求调剂
已经有5人回复
070300化学学硕求调剂
已经有5人回复
277材料科学与工程080500求调剂
已经有3人回复
0703化学调剂 ,六级已过,有科研经历
已经有5人回复
环境工程调剂
已经有4人回复
» 抢金币啦!回帖就可以得到:
招收苏州国家实验室和苏州大学联合培养博士(2026年9月入学)
+1/82
郑州大学付永柱课题组诚招2026年入学博士生
+1/80
物理学 调剂
+1/80
何时使用 CODA™ 科里奥利质量流量仪表- 艾里卡特(Alicat)
+2/52
西北工业大学光子学研究团队诚聘博士后!
+2/44
关于碳量子点抗菌的研究
+1/35
0854电子信息调剂,集成电路,芯片方向,闽南师范大学光电芯片研发实验室
+1/31
上海交通大学药学院高杨课题组诚聘博士后
+1/14
2026年上海大学王亮课题组招收电催化或光催化研究背景的博士生
+2/10
福州大学国家级人才汤育欣教授课题组2026年招收”申请考核制“储能电池方向博士研究生
+1/9
华中科技大学管理学院招聘社会用工(科研助理)1名
+1/8
青岛科技大学可持续高分子团队 考研招生
+1/7
福建农林大学绿色光电器件与储能电池团队招收2026年研究生(含调剂)
+1/5
南方科技大学生命科学学院基础免疫与微生物学系招收博士后
+1/5
西安交通大学生命学院智能化诊疗装备研究中心2026年博士生招生
+1/5
重庆大学诚招2026年生物材料方向博士生
+1/4
香港科技大学(广州) 招收温室气体监测与减排方向的博士、博后、硕士、RA
+1/4
085404 270求调剂,b区求导师收留接受跨专业
+1/2
五邑大学环境与化学化工学院欢迎化学、化工、材料背景考生报考
+1/1
招收环工、环科、化工、应化、化学、生工、生物、材化等相关专业研究生,要求过国家线
+1/1
2楼2018-08-31 09:30:57
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
|
包含不了,msi2lmp作者已停止更新,并且缺少很多种键型数据,转换时最多只能保证键、键角、二面角的位置,键能、长、键角信息需要你参考文献,自己手动输入,在使用时加入-ignore参数你就可以自己输入,注意删除转换后data文件中的lj/cut/coul/long力场信息 发自小木虫Android客户端 |
8楼2018-08-31 12:02:02
9楼2019-04-02 19:57:07
10楼2019-04-02 23:12:52
11楼2020-03-10 06:36:26
简单回复
nono20093楼
2018-08-31 09:30
回复
举重若轻I(金币+1): 谢谢参与
·
tzynew4楼
2018-08-31 09:43
回复
举重若轻I(金币+1): 谢谢参与
tableman5楼
2018-08-31 10:43
回复
举重若轻I(金币+1): 谢谢参与
2018-08-31 11:51
回复
举重若轻I(金币+1): 谢谢参与
youngen7楼
2018-08-31 12:00
回复
举重若轻I(金币+1): 谢谢参与













回复此楼