| 查看: 1641 | 回复: 10 | ||||
[交流]
lammps的输入data文件怎么样才能包含键位信息？
|
||||
|
请问一下各位大神，我在lammps里面想使用morse势函数，例如 bond_style morse bond_coeff 5 1.0 2.0 1.2 我的输入文件是从MS导出的pdb文件，然后用VMD转化成的data文件， 可是发现里面不含键的信息，请问一下data文件怎么样才能包含键位信息和原子信息？ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 分子动力学-初级问题资源 |
» 猜你喜欢
一志愿北交大材料工程总分358求调剂
已经有9人回复
-
286求调剂
已经有11人回复
-
求调剂！生物与医药专硕
已经有6人回复
-
362求调剂一志愿中国石油大学
已经有4人回复
-
085600，321分求调剂
已经有14人回复
-
材料调剂
已经有4人回复
-
一志愿生物与医药，296分，求调剂
已经有11人回复
-
346分的生物与医药08600求调剂
已经有7人回复
-
071000生物学调剂
已经有6人回复
-
一志愿郑州大学材料与化工085600，求调剂
已经有25人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
淮北师范大学资源与环境硕士研究生调剂名额充足（26人），欢迎调剂。
+2/148
-
生物与医药专业硕士调剂（河北大学 化学与材料科学学院）
+2/98
-
江西科技师范大学 材料与能源招收调剂研究生
+1/92
-
聊城大学省重点实验室 收化学专业硕士调剂、网上面试无笔试、名额充足、可调专业广泛
+1/81
-
一志愿前4位代码0703均可报名-河北大学分析化学专业招收调剂考生
+2/68
-
研究生调剂招生（44名）
+1/40
-
接工学跨专业调剂学生，非诚勿扰，谢谢
+1/38
-
信息工程大学教授团队网络空间安全专业博士招生【2026年4月5日报名截止】
+2/26
-
岭南师范学院生物与医药专业（生物技术与工程领域）2026年调剂公告
+1/22
-
大连大学 化学专业 招收26年硕士研究生调剂
+1/17
-
首都师范大学化学系田洋课题组专硕招调剂生
+1/10
-
坐标上海， 90后大叔诚征女友
+1/9
-
武科大冶能学院招收材料、冶金、能源环境、机械等相关专业调剂生
+1/9
-
【调剂上岸】985联合培养！1007/1055/08/07等，不限专业，想联培的速来！
+1/8
-
太原科技大学材料科学与工程学院“03高性能轻质合金及新能源材料”学硕与专硕有缺额
+1/5
-
河北大学分析化学招收多名调剂考生
+1/4
-
2026年云南大学青拔课题组招收地理学，大气科学、资源与环境等专业研究生
+1/3
-
闽江大学 青椒硕导 控制工程研究生招生啦
+1/3
-
招聘电池方向博士
+1/1
-
差旅首选:第一次出差珠海开住宿餐饮发票实体店电子专用,保姆级教程请收好
+1/1
2楼2018-08-31 09:30:57
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
|
包含不了，msi2lmp作者已停止更新，并且缺少很多种键型数据，转换时最多只能保证键、键角、二面角的位置，键能、长、键角信息需要你参考文献，自己手动输入，在使用时加入-ignore参数你就可以自己输入，注意删除转换后data文件中的lj/cut/coul/long力场信息 发自小木虫Android客户端 |
8楼2018-08-31 12:02:02
9楼2019-04-02 19:57:07
10楼2019-04-02 23:12:52
11楼2020-03-10 06:36:26
简单回复
nono20093楼
2018-08-31 09:30
回复
举重若轻I(金币+1): 谢谢参与
·
tzynew4楼
2018-08-31 09:43
回复
举重若轻I(金币+1): 谢谢参与
tableman5楼
2018-08-31 10:43
回复
举重若轻I(金币+1): 谢谢参与
2018-08-31 11:51
回复
举重若轻I(金币+1): 谢谢参与
youngen7楼
2018-08-31 12:00
回复
举重若轻I(金币+1): 谢谢参与
