| 查看: 1748 | 回复: 10 | ||||
[交流]
lammps的输入data文件怎么样才能包含键位信息?
|
||||
|
请问一下各位大神,我在lammps里面想使用morse势函数,例如 bond_style morse bond_coeff 5 1.0 2.0 1.2 我的输入文件是从MS导出的pdb文件,然后用VMD转化成的data文件, 可是发现里面不含键的信息,请问一下data文件怎么样才能包含键位信息和原子信息? |
» 收录本帖的淘帖专辑推荐
分子动力学-初级问题资源 |
» 猜你喜欢
小木虫没落了,除了祈祷帖子,几乎看不到有价值的帖子
已经有15人回复
面上的水很深
已经有18人回复
国社科通讯评审
已经有5人回复
5个%2F,非固定段22个字母
已经有9人回复
生命口C13面上会评时间
已经有11人回复
内心匮乏
已经有16人回复
生命口面上会评结束了吗大家有知道结果吗?现在还没有结果正常不?
已经有9人回复
投英文期刊如何查重
已经有6人回复
伯胺上甲基求助
已经有7人回复
跨出版社商投稿
已经有5人回复
» 抢金币啦!回帖就可以得到:
坐标山东,诚征女友
+1/411
祈福面上
+5/315
【哈工大-材料学院-新材料及成形技术-招收博士、硕士研究生】长期有效
+2/118
深圳大学材料学院招聘专职副研究员1人,博士后2~3人
+1/83
将研究内容相同或相近的项目以不同项目类型申请基金,还行不行?
+1/82
年薪40W+项目论文绩效,广州医科大学招收骨科、生物材料相关背景博士后2名
+1/81
哈工大医康学院材料模拟计算方向人才(全职正高、副高和博士后人员)招聘
+1/78
复旦大学李鹏课题组/香港理工大学马凯凯联合培养博士
+1/65
【重磅招聘】小巨人企业西顿高薪招聘水性树脂研发博士、硕士(广州)
+1/58
安徽医科大学马艳教授长期诚招优秀博士后人才加盟!
+1/30
西安交通大学补亚忠课题组招聘博士生
+1/28
希望面上有好消息:D:D:D
+2/20
华中农业大学植物科学技术学院李国田老师课题组劳动聘用制科研助理招聘公告
+1/12
人生失去与收获
+1/8
中国科学院宁波材料技术与工程研究所招收研究生
+1/8
哈工大马樱招收2027级计算机类、集成电路类博士生
+1/8
双一流高校招收博士(现代技术管理/环境技术经济管理)及硕士研究生(长期有效)
+1/6
Scientific Journal of Intelligent Systems Research 期刊简介
+1/5
诚邀生物医用材料领域学者加入Biofunctional Materials青年编委(Scopus收录)
+1/5
福州大学吴衔誉教授课题组 诚招2027届博士生
+1/2
2楼2018-08-31 09:30:57
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
|
包含不了,msi2lmp作者已停止更新,并且缺少很多种键型数据,转换时最多只能保证键、键角、二面角的位置,键能、长、键角信息需要你参考文献,自己手动输入,在使用时加入-ignore参数你就可以自己输入,注意删除转换后data文件中的lj/cut/coul/long力场信息 发自小木虫Android客户端 |
8楼2018-08-31 12:02:02
9楼2019-04-02 19:57:07
10楼2019-04-02 23:12:52
11楼2020-03-10 06:36:26
简单回复
nono20093楼
2018-08-31 09:30
回复
举重若轻I(金币+1): 谢谢参与
·
tzynew4楼
2018-08-31 09:43
回复
举重若轻I(金币+1): 谢谢参与
tableman5楼
2018-08-31 10:43
回复
举重若轻I(金币+1): 谢谢参与
2018-08-31 11:51
回复
举重若轻I(金币+1): 谢谢参与
youngen7楼
2018-08-31 12:00
回复
举重若轻I(金币+1): 谢谢参与











回复此楼