| 查看: 1670 | 回复: 10 | ||||
[交流]
lammps的输入data文件怎么样才能包含键位信息?
|
||||
|
请问一下各位大神,我在lammps里面想使用morse势函数,例如 bond_style morse bond_coeff 5 1.0 2.0 1.2 我的输入文件是从MS导出的pdb文件,然后用VMD转化成的data文件, 可是发现里面不含键的信息,请问一下data文件怎么样才能包含键位信息和原子信息? |
» 收录本帖的淘帖专辑推荐
分子动力学-初级问题资源 |
» 猜你喜欢
研究生做的很差,你们会让毕业吗?
已经有9人回复
求碳排放博导;方向是LCA、生命周期可持续发展以及碳排放
已经有7人回复
2026博士申请求助
已经有4人回复
2026博士或科研助理转27年博士
已经有7人回复
急招2026年9月份入学博士
已经有3人回复
26申博
已经有3人回复
申博自荐
已经有7人回复
26年博士申请自荐-电催化
已经有7人回复
2026年博士申请求捞
已经有3人回复
国自科送审了吗
已经有11人回复
» 抢金币啦!回帖就可以得到:
坐标南京,诚租女友
+5/9316
上海嘉定周边俩小时车程
+5/170
山东大学深地储能系统工程课题组常年招聘优秀博士后研究人员
+1/84
河南师范大学水产学院博士研究生招生
+1/83
太行山徒步之凌水河(二)
+1/74
在广东佛山,等一个她
+1/72
2026年江西师范大学流动化学与工程研究院陈芬儿院士团队化学博士招生
+3/68
上海大学先进耐火材料团队招收博士研究生多名
+1/46
苏州科技大学国家高层次青年人才团队诚聘副教授/讲师(事业编)和科研助理数名
+1/39
苏州科技大学国家高层次青年人才团队诚聘副教授/讲师(事业编)和科研助理数名
+1/36
松山湖材料实验室-大连理工大学联合招收2027年博士研究生调剂考生若干名
+1/34
乙酰化木聚糖的购买途径或提取方法及乙酰含量测定
+3/12
中国农业大学资源与环境学院 - 招聘杰出人才、青年研究员、优秀人才和博士后
+1/11
又是一年基金申报,焦虑,某些学术大佬能不能少点干预
+1/8
天津医科大学王霆教授团队,诚招2026级申请考核制博士生1名
+1/8
港科大广州 - 量子计算全额奖学金博士招聘(申请制,2026和2027均有名额)
+1/4
南京大学医学院医学数字孪生方向博士后招聘
+1/2
双一流高校南林化学工程学院-国家级青年人才团队招2026级博士(最后一波)
+1/1
南京大学医学院附属鼓楼医院院士团队招聘博士后、科研助理
+1/1
李老师课题组急招收生物信息学方向博士研究生!
+1/1
2楼2018-08-31 09:30:57
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
|
包含不了,msi2lmp作者已停止更新,并且缺少很多种键型数据,转换时最多只能保证键、键角、二面角的位置,键能、长、键角信息需要你参考文献,自己手动输入,在使用时加入-ignore参数你就可以自己输入,注意删除转换后data文件中的lj/cut/coul/long力场信息 发自小木虫Android客户端 |
8楼2018-08-31 12:02:02
9楼2019-04-02 19:57:07
10楼2019-04-02 23:12:52
11楼2020-03-10 06:36:26
简单回复
nono20093楼
2018-08-31 09:30
回复
举重若轻I(金币+1): 谢谢参与
·
tzynew4楼
2018-08-31 09:43
回复
举重若轻I(金币+1): 谢谢参与
tableman5楼
2018-08-31 10:43
回复
举重若轻I(金币+1): 谢谢参与
2018-08-31 11:51
回复
举重若轻I(金币+1): 谢谢参与
youngen7楼
2018-08-31 12:00
回复
举重若轻I(金币+1): 谢谢参与












回复此楼