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yf-deng金虫 (正式写手)
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[交流]
如何进行微卫星引物筛选及扩增条件优化
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大家好！最近在学习做微卫星，引物是引用别人硕士论文中的，图1是三对微卫星引物的扩增结果，图2是其中一对引物在亲本和杂交子代中的扩增情况，现有一下疑问，请大家不吝赐教！ 1，这三对引物在同属非同种的A和B中都能扩增出大小不等的条带，理论上应该是可以做亲子代鉴定的标记（不知道我这样理解是否正确），但是由于片段差异过小，要想在图中区分开来是否一定得要聚丙烯酰胺胶才能分开？不知道可有更好的办法。谢谢！ 2，图2是图1中第二对引物在亲本和子代中的扩增结果，子代中的条带很模糊，产率不高。请问有何种方法改进？降低退火温度？加大模板量？ 3，在筛选引物的时候我发现有的引物只在A中有扩增结果（图三），那么该引物用于亲子鉴定是否有意义？ [ Last edited by yf-deng on 2009-4-4 at 15:43 ] |
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yf-deng
金虫 (正式写手)
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2楼2009-04-05 00:58:00