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yf-deng

金虫 (正式写手)

[交流] 如何进行微卫星引物筛选及扩增条件优化

大家好!最近在学习做微卫星,引物是引用别人硕士论文中的,图1是三对微卫星引物的扩增结果,图2是其中一对引物在亲本和杂交子代中的扩增情况,现有一下疑问,请大家不吝赐教!

1,这三对引物在同属非同种的A和B中都能扩增出大小不等的条带,理论上应该是可以做亲子代鉴定的标记(不知道我这样理解是否正确),但是由于片段差异过小,要想在图中区分开来是否一定得要聚丙烯酰胺胶才能分开?不知道可有更好的办法。谢谢!

2,图2是图1中第二对引物在亲本和子代中的扩增结果,子代中的条带很模糊,产率不高。请问有何种方法改进?降低退火温度?加大模板量?

3,在筛选引物的时候我发现有的引物只在A中有扩增结果(图三),那么该引物用于亲子鉴定是否有意义?

[ Last edited by yf-deng on 2009-4-4 at 15:43 ]
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yf-deng

金虫 (正式写手)

各位大侠帮帮忙呀!
2楼2009-04-05 00:58:00
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