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金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】【求助】做CoMFA时如何选取分子的低能构象

做CoMFA时,用Minimize能得到某个分子的低能构象,用Dynamics中的模拟退火又能得到一个低能构象,用系统构象搜寻方法又能得到很多低能构象,那么到底用哪种方法得到的低能构象来进行分子叠合呢

[ Last edited by zdhlover on 2009-11-22 at 13:17 ]
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)

★ ★
jghe(金币+2,VIP+0):感谢你参与讨论 4-1 20:13
哪一种都可以,哪一种都有自身的缺陷。你或许比较一下,看看哪种更适合你。
2楼2009-04-01 15:39:15
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ky96998

金虫 (小有名气)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 4-20 18:39
如果已知受体结构和活性位点可以做基于分子对接来选择低能构象。如果不能做分子对接,那么楼主所谓的几种方法都可以,都有人那样做而且发了文章。
3楼2009-04-10 23:55:12
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