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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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ln79411749

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】求教同源模建的RMSD值

求教同源模建的RMSD值在多少范围内是可以接受的？

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 21:40 ]
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1楼 2009-03-31 21:04:45
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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)
★
mingdong(金币+1,VIP+0):谢谢！ 4-2 11:46
同源模建的序列相似性应该不能少于30%，RMSD<1
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2楼2009-04-01 08:31:51
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ln79411749

铜虫 (小有名气)
我做的模型RMSD值最小的也有2.17，如果进一步通过分子动力学等方法对模型进行优化有没有可能是RMSD值达到可以接受的范围以内呢？
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3楼2009-04-01 14:40:24
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wuchenwf

荣誉版主 (职业作家)
RMSD是什么，我们用一个MSD 叫 mean square displacement  这两个 好像没有什么关系是不是
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4楼2009-04-02 21:23:49
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ln79411749

铜虫 (小有名气)
RMSD是构建的模型与模板蛋白之间距离的均方根值，是评价同源模型的一种方法，只是我的模型构建的不好，RMSD值太大，不知道有没有继续进一步研究的意义？
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5楼2009-04-04 09:01:15
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