24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1756  |  回复: 4
当前主题已经存档。

wuping7550

[交流] 【求助】请问构象搜索用什么软件?

一个小的有机分子,可能有很多中构象,有没有软件能自动找到改分子最稳定的几个构象?请牛人告诉我一下,谢谢
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州

★ ★
yuhuobuku(金币+2,VIP+0):欢迎参加讨论 4-8 09:31
寻求总体最优解的问题在计算科学中是一个很棘手的。有人推测如果有方法可以确定蛋白质等大分子的最稳定构象将是一个分量很足的炸药奖。

至今没有实用的软件。但有很多方法(算法,思想)可以近似得到。
比如MC,MD,退火等。
2楼2009-03-31 21:38:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)

★ ★
yuhuobuku(金币+2,VIP+0):欢迎参加讨论 4-8 09:31
sybyl中有很多构象搜索的方法,你可以分别尝试一下。
3楼2009-04-01 08:16:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wuping7550

多谢.我好想听人说有,我要搜索的只是很小的有机分子稳定的构象。不是蛋白质的。那个太大了
4楼2009-04-01 22:49:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuhuobuku

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by wuping7550 at 2009-4-1 22:49:
多谢.我好想听人说有,我要搜索的只是很小的有机分子稳定的构象。不是蛋白质的。那个太大了

kick方法
BH搜索
自己google查一下具体方法吧
但是不能找到最稳定的结构
稳定性还得做频率分析
自己寻找
薄酒可以忘忧,丑妻可以白头,徐行不必驷马,称身不必狐裘平淡才是生活的主旋律
5楼2009-04-08 09:32:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wuping7550 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 申博自荐 +5 Linxia林夏 2026-04-13 5/250 2026-04-20 19:17 by YuY66
[考研] 320求调剂 +6 深郊akm 2026-04-17 6/300 2026-04-20 18:57 by fs26jie
[论文投稿] 有没有接收比较快的sci期刊呀,最好在一个月之内的,研三孩子求毕业 20+4 之护着 2026-04-16 7/350 2026-04-20 15:45 by 豆豆7758
[教师之家] 又一批高校组建人工智能学院 师资行吗 不是骗人吗 +4 yexuqing 2026-04-19 4/200 2026-04-20 14:47 by brantleo
[考博] 申博 +3 Xyyx. 2026-04-18 3/150 2026-04-20 10:44 by YuY66
[考博] 湖南大学刘巧玲课题组2026年第二批次博士研究生招生信息 +3 南风观火 2026-04-18 5/250 2026-04-20 10:13 by 南风观火
[考研] 求计算机方向调剂 +3 Toffee2 2026-04-16 6/300 2026-04-19 22:37 by ll叶
[考研] 297,工科调剂? +11 河南农业大学-能 2026-04-14 11/550 2026-04-19 20:07 by Equinoxhua
[考研] 求调剂推荐 +9 小聂爱学习 2026-04-14 9/450 2026-04-19 17:03 by 中豫男
[考研] 291求调剂 +12 关忆北. 2026-04-14 13/650 2026-04-19 16:50 by 中豫男
[考研] 085404 22408 309分求调剂 +10 lzmk 2026-04-14 11/550 2026-04-19 16:42 by 中豫男
[考研] 求调剂 +6 苦命人。。。 2026-04-18 7/350 2026-04-19 16:27 by 中豫男
[考研] 294求调剂 +15 淡然654321 2026-04-15 15/750 2026-04-19 08:20 by cuisz
[考研] 接受任何调剂 +6 也就是栗子 2026-04-17 7/350 2026-04-18 17:20 by 涵竹刘
[考研] 297,工科调剂? +5 河南农业大学-能 2026-04-14 5/250 2026-04-18 15:17 by Equinoxhua
[考研] 急需调剂 +9 绝不放弃22 2026-04-15 10/500 2026-04-18 08:09 by chixmc
[有机交流] 二苯甲酮酸类衍生物 50+3 小白爱主人 2026-04-17 6/300 2026-04-17 18:47 by kf2781974
[考研] 322求调剂 +6 tekuzu 2026-04-17 6/300 2026-04-17 13:48 by Espannnnnol
[基金申请] RY:中国产出的科学垃圾论文,绝对数量和比例都世界第一 +7 zju2000 2026-04-14 18/900 2026-04-16 11:36 by 欢乐颂叶蓁
[考研] 药学求调剂 +14 喽哈加油 2026-04-14 16/800 2026-04-16 10:15 by beilsong20
信息提示
请填处理意见