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zhuzhu1995

新虫 (初入文坛)

[交流] LR反应,测序总是不对,表达载体构建反复失败,这是为什么?

各位大神大家好, 微生物菜鸟一枚。最近在LR这失败了两个月, 都没有找到原因,

我的入门载体是PGWC,已连接好我的CDS进行了测序,现在我通过gateway技术将我的基因从入门载体LR到表达载体

送测序了大概7.8次,我有6个表达载体都需要构建

测序结果 :   头两次是测序公司打电话说细胞壁没办法裂解,没法提质粒,我自己从过去质粒他说我质粒无信号,我用自己克基因引物测的
                     后来又送了两批,送的菌液,结果是测序失败。我自己提质粒 这边我就提不出来了 测序公司打电话说怀疑是污染,用自己克基因引物测的
                    用了别人提的表达载体质粒 又送过去了一波,测序成功了 相似度百分之20多,不是我的东西, 用PGWB表达载体通用引物测序的
                    我又用了买的DH5感受态,又送过去了一波, 测序显示有重叠峰,我把测序结果到NCBI上比对了一下,发现是我的表达载体的序列。

现在不知道怎么办了 ,等着载体成功后转农杆菌呢,这重复无意义的工作,还没有找到原因。烟草都种了好几批了,请问问题出在哪,我应该怎么办

跪谢
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yangang18

禁虫 (初入文坛)

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2楼2018-10-28 13:55:40
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凌儿凌夷

铜虫 (小有名气)

合成一个质粒,然后再自己酶切,链接吧,这样太浪费时间了,还花钱
3楼2018-11-01 08:06:56
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好运连连OK

新虫 (小有名气)

前面两次你都是用你自己的特异性引物进行测序的,无信号的话就证明是空载了,后面是你的表达载体序列那么还是空载,或者你的载体改造过,建议你先做个TA克隆看下

发自小木虫Android客户端
4楼2018-11-01 10:32:08
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蝶恋花5280

铁虫 (小有名气)

gateway那个重组酶太傲娇了,有时候只是在冰上几分钟就失去活性,我以前也和你一样总是连不上。后来就找别的课题组要了2uL酶居然就连上了。时间还是耽误不少啊,用gateway技术本来就图它构建载体快,可是我自认为得不偿失啊。而且pGWB5这个载体左右边界中间的一段有10kbp太大了,插入烟草基因组的片段越大越难转化,而且还有一个GFP蛋白,如果你们组没有相应做蛋白的技术的话,基本上没用,也就只能等转基因烟草出来了,在荧光显微镜下看看根里面有没有GFP
5楼2018-11-05 16:22:15
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wswshuai_ccl

银虫 (小有名气)

你做了第一步BP反应吗?  BP阳性的话,LR怎么做都能成功的啊。  质粒还是要自己提出来,做了酶切再送测序啊。
6楼2018-11-08 01:01:23
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wx12355

新虫 (初入文坛)

你好楼主你的问题解决了吗?我有两个基因,一个LR反应成功了,一个几次了都不成功,酶太贵了又不好跟老师说,找不到问题,我看测序结果了,BP接头也加上了的,两个基因我自己一起没做出来,换了师妹做,一个就成功了,一个怎么都不成功,现在不知道是不是酶的原因了,隔了一天就做不出来,很烦,看你的这是新帖,希望以后有经验一起分享,实验室就我一个人在做这个
7楼2018-11-20 20:17:05
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wx12355

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 好运连连OK at 2018-11-01 10:32:08
前面两次你都是用你自己的特异性引物进行测序的,无信号的话就证明是空载了,后面是你的表达载体序列那么还是空载,或者你的载体改造过,建议你先做个TA克隆看下

我的入门载体是PDONR221,表达载体是PGW551,这个如果要酶切验证的话,怎么验证?用什么酶酶切
8楼2018-11-20 20:22:54
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