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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » gromacs做拉伸动力学
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TANXIAOHUI

新虫 (初入文坛)

[求助] gromacs做拉伸动力学 已有1人参与

在用gromacs做拉伸动力学的时候，在执行命令grompp_mpi -f pull.mdp -c npt.gro -p topol.top -n index.ndx -t npt.cpt -o pull.tpr时，出现如下错误：
Fatal error:
Group pull_group1 required by grompp was undefined.
一直没找着原因，请问各位大神，这个问题该如何解决呀？谢谢

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1楼 2018-07-20 16:28:45
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cjl123321

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
需要修改pull.mdp文件，需要定义两个组，一个组固定，一个组牵引。你少定义了一个组

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TANXIAOHUI
2楼2018-07-20 20:07:46
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TANXIAOHUI

新虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by cjl123321 at 2018-07-20 20:07:46
需要修改pull.mdp文件，需要定义两个组，一个组固定，一个组牵引。你少定义了一个组

尝试了好多次，终于可以了，非常感谢！谢谢！

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3楼2018-07-22 11:22:43
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