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【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by kkkkk76 at 2018-07-11 20:16:30
谢谢回复,不知道这个测序深度需要怎么去确定,目前在做的是RNA+ChIP-seq,数据产出分别在6G和10G左右,由于样品原因,存在了两个物种,现在产出数据与这两个物种的reads mapping分别在20%和70%左右,两种测序的的 ...

这个取决很多方面,你的genome多大?有refrence genome 吗?read长度多少?
病毒基因组很小,也许6G*20%=1.2G就够了。
比较严谨的做法是,也是相对比较懒的办法,类比文献,比如nature science的 paper 中RNAseq都用多少data,
Progress in science depends on new techniques, new discoveries and new ideas, probably in that order. -- Nobel laureate Sydney Brenner
11楼2018-07-12 23:21:26
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