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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 微生物群落多样性测序是否需要取三份样品进行平行测序?
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鸭梨要吃肉

新虫 (正式写手)

[交流] 微生物群落多样性测序是否需要取三份样品进行平行测序?

最近发现一些SCI论文微生物群落多样性测序，好像每个样品只测一次，但是一般做实验不是都要测三个平行样吗？难道多样性测序不需要测三个平行样？希望做过微生物多样性的前辈帮我解答一下。

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1楼 2018-07-09 12:47:53
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小马科研部落

新虫 (小有名气)
★
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引用回帖:
8楼: Originally posted by 鸭梨要吃肉 at 2018-07-12 17:54:26
那就是说一般文献既没有做技术重复和生物学重复，是吗？
...

一般文献是做了生物学重复，比如实验有2组不同的处理，假设1组是健康组，1组是疾病组。文献中，一般健康组会取至少3个以上样本，疾病组也会是取3个以上样本。那么疾病组和健康组里的样本，可以看做是生物学重复。
微生物多样性检测，之所以不做技术重复，是因为里面分子实验和测序时都会存在随机误差，同1个样本，经过2次检测，即使是实验步骤和后续分析参数完全相同，其结果也不会完全相同的。
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鸭梨要吃肉
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9楼2018-07-13 10:04:14
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小马科研部落

新虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小冀-: 金币+3, 鼓励回帖交流 2018-07-12 22:00:16
是需要测平行的，但不是1个样本测3次。
而是1组内设置3个及以上样本，组内的3个及以上样本，就是设计的生物学平行。
另外在数据分析时，会分析组内的差异，也会分析组间的差异。
这样就会区别分组信息，是否合理了。
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2楼2018-07-09 14:14:17
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鸭梨要吃肉

新虫 (正式写手)
那意思就是一组里面设置3个或3个以上的同一样本，然后进行处理测序吗？

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3楼2018-07-10 12:15:45
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在水壹方

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
由于测微生物多样性测序，个体差异比较大，一般一组都是重复10次

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4楼2018-07-11 21:28:05
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