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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】autodock4使用中遇到的难题？
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loone

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】autodock4使用中遇到的难题？

本人是在windows下使用autodock4，在autogrid成功之后，进行autodock这一步的时候出项下列现象；



autodock4: error: Unknown ligand atom type : "B" ;add parameters for it the parameter library first!

  

敬请高手指点，谢谢！

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 21:40 ]
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starthere,makeadifference
1楼 2009-03-29 22:27:20
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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)
★ ★
jghe(金币+2,VIP+0):感谢你参与讨论 4-1 20:13
仔细检查一下你小分子pdb或mol2文件中的原子类型。
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2楼2009-04-01 08:30:55
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长
★
jghe(金币+1,VIP+0):感谢你参与讨论 4-1 20:13
嗯，同意楼上，仔细找文件中B类型的原子看是什么？
赞一下(10人) 回复此楼
个人博客：[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
3楼2009-04-01 18:15:29
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