应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 考虑周期性边界条件怎么计算键角分布
51/1返回列表
查看: 1606  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

想发TOP

新虫 (初入文坛)

[求助] 考虑周期性边界条件怎么计算键角分布 已有1人参与

大家好，我是做熔盐分子动力学模拟的，用的是Forcite模块，现在在探索怎么根据最终得到的轨迹文件里的原子坐标计算键角分布，但是我如果要考虑周期性边界条件的话，不知道怎么去编程计算，如果考虑周期性边界条件，需要注意哪些吗，对周期性边界条件一直是一知半解，希望有大神能解惑，谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2018-07-05 09:16:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

想发TOP

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by xzz1007 at 2018-07-05 10:10:21
啥意思？
把卡在边缘的分子，先弄到一个周期里吧，具体的要看你的盒子大小了吧，统计一下坐标，然后小于周期一半的，看看是加还是减周期

有坐标了，计算角度也不是问题吧

我的盒子大小是14埃左右，你的意思是小于周期一一半的原子坐标都要加盒子长度吗
赞一下 回复此楼
4楼2018-07-05 10:40:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

想发TOP

新虫 (初入文坛)
自己顶一下，各位大神能否指点一二，虫友们都是我的导师啊
赞一下 回复此楼
2楼2018-07-05 09:19:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xzz1007

金虫 (小有名气)
啥意思？
把卡在边缘的分子，先弄到一个周期里吧，具体的要看你的盒子大小了吧，统计一下坐标，然后小于周期一半的，看看是加还是减周期

有坐标了，计算角度也不是问题吧
赞一下(1人) 回复此楼
阳光总在风雨后，再坚持坚持吧.....
3楼2018-07-05 10:10:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

想发TOP

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by xzz1007 at 2018-07-05 10:10:21
啥意思？
把卡在边缘的分子，先弄到一个周期里吧，具体的要看你的盒子大小了吧，统计一下坐标，然后小于周期一半的，看看是加还是减周期

有坐标了，计算角度也不是问题吧

补充一下，我是想先计算配离子的类型，比如4配位，5配位，6配位三种类型的分布
赞一下 回复此楼
5楼2018-07-05 10:48:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 311求调剂 +5 lin0039 2026-03-26 5/250 2026-03-26 22:43 by 学员8dgXkO
[考研] 324求调剂 +4 wysyjs25 2026-03-21 4/200 2026-03-26 20:38 by fmesaito
[考研] 07化学280分求调剂 +8 722865 2026-03-23 8/400 2026-03-26 20:00 by 不吃魚的貓
[考研] 考研调剂 +8 小蜡新笔 2026-03-26 8/400 2026-03-26 16:18 by dick_runner
[考研] 22 350 本科985求调剂，求老登收留 +4 李轶男003 2026-03-20 4/200 2026-03-26 16:05 by 哇啦啦啦xtj
[考研] 北科281学硕材料求调剂 +17 tcxiaoxx 2026-03-20 19/950 2026-03-26 16:04 by 不吃魚的貓
[考研] 311求调剂 +4 勇敢的小吴 2026-03-20 4/200 2026-03-25 18:12 by xcjcqu
[考研] 网络空间安全0839招调剂 +4 w320357296 2026-03-25 6/300 2026-03-25 17:59 by 255671
[考研] 【2026考研调剂】制药工程 284分 求相关专业调剂名额 +4 袁奂奂 2026-03-25 8/400 2026-03-25 14:32 by lbsjt
[考研] 300分，材料，求调剂，英一数二 +5 超赞的 2026-03-24 5/250 2026-03-24 21:07 by 星空星月
[考研] 一志愿南航材料专317分求调剂 +5 炸呀炸呀炸薯条 2026-03-23 5/250 2026-03-24 16:52 by 星空星月
[考研] 307求调剂 +3 余意卿 2026-03-21 6/300 2026-03-24 15:03 by 余意卿
[考研] 一志愿山东大学药学学硕求调剂 +3 开开心心没烦恼 2026-03-23 4/200 2026-03-24 00:06 by 开开心心没烦恼
[考研] 求调剂 +7 十三加油 2026-03-21 7/350 2026-03-23 23:48 by 热情沙漠
[考研] 384求调剂 +3 子系博 2026-03-22 6/300 2026-03-23 21:45 by 子系博
[考研] 336化工调剂 +4 王大坦1 2026-03-23 5/250 2026-03-23 18:32 by allen-yin
[考研] 求调剂一志愿海大，0703化学学硕304分，有大创项目，四级已过 +6 幸运哩哩 2026-03-22 10/500 2026-03-22 20:10 by edmund7
[考研] 324求调剂 +6 lucky呀呀呀鸭 2026-03-20 6/300 2026-03-22 16:01 by ColorlessPI
[考研] 材料求调剂 +5 @taotao 2026-03-21 5/250 2026-03-21 20:55 by lbsjt
[考研] 一志愿 南京航空航天大学大学 ，080500材料科学与工程学硕 +5 @taotao 2026-03-20 5/250 2026-03-20 20:16 by JourneyLucky
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭