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艾august

新虫 (初入文坛)

[求助] Gromacs pdb中氨基酸缺失补loop chimera

用gromacs进行MD模拟,发现PDB中有氨基酸缺失,根据网络教程用chimera补pdb中缺失的氨基酸,但是保存完一直看不到缺失的序列补齐,有大神会嘛?或者有其他方法能够补pdb中的氨基酸,求教?♀??♀??♀?

@smutao 发自小木虫IOS客户端
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astrozheng

银虫 (小有名气)

可以用swissmodel, 补全完后应该能够看到缺失序列。或者modeller, 或者loopy, 只是补全缺失段,再加入到原pdb中。不过我一般都是选前一种,简单方便。

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个人签名用英文会没有空格,真是个bug.
2楼2018-06-29 10:00:09
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