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分子模拟
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| 我是研究的KGM（聚合物、含有氢和氧）和水的水合过程，我先把KGM和水里的氢和氧分别set，设置成KH、KO、WH、WO，然后建盒子，MD模拟，用的是compassⅡ力场，NVT系统，10个kgm分子，2000个水分子。观察能量和温度图，看最后的轨迹平衡状态对应哪些帧，在最后通过forcite-analysis做RDF分析，在set里选择WH和WO，cutoff设置为盒子长度的一半，点击analysis得到std和xcd文件，在std文件里点击inter（WH-WO），发现g（r）都是0，模拟过程出错？还是别的问题？ |
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