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rain841230捐助贵宾 (正式写手)
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几个关于shelx的问题
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在shelx的XL结构精修中： 1.如果在需要精修的结构中已知某些原子偏离了它所对应空间群的理论位置，需要对其位置坐标进行精修，改怎么操作？ 2.如果精修前知道A和B原子可能共同占有一个位置，应该添加什么指令到.ins文件才能实现精修？比如在某个等效位置上可能分布有80%的A和20%的B原子，精修的初始模型很可能这个位置上只占有A。那么是不是我只需要把A和B原子的占有率数值前的“1”删去，然后再自行添加一行B原子在那个坐标位置的指令，并且把初始占有率设为0.000，程序就会自行精修得到结果了呢？？ 3.经过一轮精修以后的.res文件（请看附件），里面显示了有两个分子结构，是不是说明调制结构（modulated structure)的存在？ 小弟不才，望前辈们指教一二，多谢！ [ Last edited by rain841230 on 2009-3-27 at 23:44 ] |
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rain841230
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请看一下在ins文件里这样的格式对吗？ WGHT 0.100000 FVAR 0.14807 0.5000 MOLE 1 RU1 4 0.000000 0.000000 0.653109 21.000 0.00966 Ni2 2 0.000000 0.000000 0.653109 -21.000 0.00966 RU2 4 0.500000 0.000000 0.500000 10.25000 0.02033 NI1 2 -0.333333 0.333333 0.750000 10.08333 0.01487 SR1 3 0.333333 0.666667 0.750000 10.08333 0.02197 Q1 1 0.666667 0.333333 0.583341 10.16667 0.01262 Q2 1 0.829170 0.170830 0.416953 10.50000 0.02255 Q3 1 -0.703720 0.148140 0.750000 10.25000 0.02476 EADP RU1 NI2 EXYZ RU1 NI2 MOLE 2 HKLF 4 为什么我精修了一轮以后 RU1 和 Ni2 的占有率还是21.000和-21.000？？ |
8楼2009-04-16 02:54:22
rain841230
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2楼2009-03-30 16:54:17
xi2004
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waiy2001(金币+3,VIP+0):呵呵，还是你是好心人，哈哈 3-30 20:39
waiy2001(金币+3,VIP+0):呵呵，还是你是好心人，哈哈 3-30 20:39
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可能因为没有金币吧. 哈哈. 1.如果在需要精修的结构中已知某些原子偏离了它所对应空间群的理论位置，需要对其位置坐标进行精修，改怎么操作？ 你说的是本来应该在特殊位置, 结果偏离一些吧? 2.如果精修前知道A和B原子可能共同占有一个位置，应该添加什么指令到.ins文件才能实现精修？比如在某个等效位置上可能分布有80%的A和20%的B原子，精修的初始模型很可能这个位置上只占有A。那么是不是我只需要把A和B原子的占有率数值前的“1”删去，然后再自行添加一行B原子在那个坐标位置的指令，并且把初始占有率设为0.000，程序就会自行精修得到结果了呢？？ 不是的吧. 另产生一套B的坐标, A的占有率为21.000, B的为-21.00, 在FVAR后第2个数字的位置添加0.80 然后还要限制, 用EADP和EXYZ 比如 La和Cd在一个位置, 则 EADP LA1 CD1 EXYZ LA1 CD1 3.经过一轮精修以后的.res文件（请看附件），里面显示了有两个分子结构，是不是说明调制结构（modulated structure)的存在？ 没有研究. 不乱说. 高手来说说. |
3楼2009-03-30 17:38:42
rain841230
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4楼2009-03-30 20:51:04