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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 求助预测的蛋白三级结构比较
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sinodina

木虫 (小有名气)

[交流] 求助预测的蛋白三级结构比较

知道几个蛋白的序列，你知道什么软件能进行两个蛋白或者三个蛋白的的三维结构的比较，最好是能在一个图中显示出两个或三个蛋白的三维结构，谁有这种软件吗？非常感谢！期盼回贴！
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1楼 2009-03-27 22:29:40
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anquren

金虫 (正式写手)
只知道序列还不行，还需要获得三维结构之后才能进行三维结构的比较
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2楼2009-03-28 16:47:50
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sinodina

木虫 (小有名气)
我现在已经有蛋白的三维结构图，怎样把他们合成一张图呢
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3楼2009-03-28 17:06:35
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anquren

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by sinodina at 2009-3-28 17:06:
我现在已经有蛋白的三维结构图，怎样把他们合成一张图呢

你有蛋白质三维结构的坐标还是图片呢？
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4楼2009-03-28 17:09:41
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sinodina

木虫 (小有名气)
有PDB格式的文件和图片
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5楼2009-03-28 17:11:37
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sinodina

木虫 (小有名气)
请教一下，你有方法可以弄到一起吗，为了对比两个蛋白结构的相似性！非常感谢！！
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6楼2009-03-28 17:12:53
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anquren

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by sinodina at 2009-3-28 17:12:
请教一下，你有方法可以弄到一起吗，为了对比两个蛋白结构的相似性！非常感谢！！

有PDB的坐标文件就可以，做一个结构叠合，结构就到一起了。
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7楼2009-03-28 17:20:08
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sinodina

木虫 (小有名气)
拜托，怎么叠合呢
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8楼2009-03-28 17:21:14
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sinodina

木虫 (小有名气)
需要别的软件吗，能否教我一下 呢！
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9楼2009-03-28 17:52:04
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shenqicc

金虫 (小有名气)
用pymol就可以了！
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10楼2009-03-28 18:36:12
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