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sinodina

木虫 (小有名气)

[交流] 求助预测的蛋白三级结构比较

知道几个蛋白的序列,你知道什么软件能进行两个蛋白或者三个蛋白的的三维结构的比较,最好是能在一个图中显示出两个或三个蛋白的三维结构,谁有这种软件吗?非常感谢!期盼回贴!
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anquren

金虫 (正式写手)

只知道序列还不行,还需要获得三维结构之后才能进行三维结构的比较
2楼2009-03-28 16:47:50
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sinodina

木虫 (小有名气)

我现在已经有蛋白的三维结构图,怎样把他们合成一张图呢
3楼2009-03-28 17:06:35
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anquren

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by sinodina at 2009-3-28 17:06:
我现在已经有蛋白的三维结构图,怎样把他们合成一张图呢

你有蛋白质三维结构的坐标还是图片呢?
4楼2009-03-28 17:09:41
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sinodina

木虫 (小有名气)

有PDB格式的文件和图片
5楼2009-03-28 17:11:37
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sinodina

木虫 (小有名气)

请教一下,你有方法可以弄到一起吗,为了对比两个蛋白结构的相似性!非常感谢!!
6楼2009-03-28 17:12:53
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anquren

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by sinodina at 2009-3-28 17:12:
请教一下,你有方法可以弄到一起吗,为了对比两个蛋白结构的相似性!非常感谢!!

有PDB的坐标文件就可以,做一个结构叠合,结构就到一起了。
7楼2009-03-28 17:20:08
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sinodina

木虫 (小有名气)

拜托,怎么叠合呢
8楼2009-03-28 17:21:14
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sinodina

木虫 (小有名气)

需要别的软件吗,能否教我一下 呢!
9楼2009-03-28 17:52:04
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shenqicc

金虫 (小有名气)

用pymol就可以了!
Publish OR Perish!
10楼2009-03-28 18:36:12
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