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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 求玉米醇溶蛋白（zein)的三级蛋白结构文件
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学海无涯2016

新虫 (小有名气)

[交流] 求玉米醇溶蛋白（zein)的三级蛋白结构文件

如题，小弟对这方面不知道该怎么下手，希望大佬们给点意见。邮箱397411692@qq.com

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1楼 2018-06-22 12:45:55
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hclwonder

新虫 (正式写手)
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
查有没有已经解出其结构。如果没有，看有没有同源性较高的模板，如果有，可以做同源模建，如果没有，就不好弄了。

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学海无涯2016
2楼2018-06-23 10:17:55
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学海无涯2016

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by hclwonder at 2018-06-23 10:17:55
查有没有已经解出其结构。如果没有，看有没有同源性较高的模板，如果有，可以做同源模建，如果没有，就不好弄了。

谢谢你

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3楼2018-06-23 12:50:35
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学海无涯2016

新虫 (小有名气)
我想做分子动力模拟所以需要一个三级蛋白结构的文件

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4楼2018-06-23 12:51:19
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polypro

木虫 (正式写手)
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参考文献：Li, Y.; Xia, Q.; Shi, K.; Huang, Q., Scaling Behaviors of α-Zein in Acetic Acid Solutions. J. Phys. Chem. B 2011, 115, (32), 9695-9702.
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学海无涯2016 学海无涯2016
泉涸,鱼相与处于陆,相呴以湿,相濡以沫,不如相忘于江湖。
5楼2018-07-17 08:44:01
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学海无涯2016

新虫 (小有名气)
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引用回帖:
5楼: Originally posted by polypro at 2018-07-17 08:44:01
参考文献：Li, Y.; Xia, Q.; Shi, K.; Huang, Q., Scaling Behaviors of α-Zein in Acetic Acid Solutions. J. Phys. Chem. B 2011, 115, (32), 9695-9702.

非常感谢您！

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6楼2018-07-17 10:36:01
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学海无涯2016

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by polypro at 2018-07-17 08:44:01
参考文献：Li, Y.; Xia, Q.; Shi, K.; Huang, Q., Scaling Behaviors of α-Zein in Acetic Acid Solutions. J. Phys. Chem. B 2011, 115, (32), 9695-9702.

您好，还有一个问题想请教您。这个PBD文件是这篇论文里面的吗？我从哪里去找这个原始文件呢？因为后面写文章需要说明，非常感谢您！

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7楼2018-07-17 11:43:49
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polypro

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by 学海无涯2016 at 2018-07-17 11:43:49
您好，还有一个问题想请教您。这个PBD文件是这篇论文里面的吗？我从哪里去找这个原始文件呢？因为后面写文章需要说明，非常感谢您！
...

结构是论文里的，对应Z19a, Z22
a-zein的两个主要成分，序列与论文里也是对应的
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泉涸,鱼相与处于陆,相呴以湿,相濡以沫,不如相忘于江湖。
8楼2018-07-18 21:43:24
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学海无涯2016

新虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by polypro at 2018-07-18 21:43:24
结构是论文里的，对应Z19a, Z22
a-zein的两个主要成分，序列与论文里也是对应的...

感谢您

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9楼2018-07-19 09:42:49
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