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R语言画PCA图，添加椭圆 已有2人参与
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大家好; 最近需要使用R语言画PCA图，而且要用椭圆把不同分组圈起来，请问椭圆怎么加啊。下面是看得网上的程序，但是不对，ellipse是加椭圆的命令，但是我画的图没有椭圆，是不是需要加载什么包啊。求教。 group = read.table("group.txt", header=F, row.names= 1, sep="\t"  otu_table_profile.sort = read.table("otu_table_profile.sort.txt", row.names= 1, header=T, sep="\t" idx = rownames(group) %in% colnames(otu_table_profile.sort) sub_group = group[idx,] ##idx组名 count = otu_table_profile.sort[, rownames(sub_group)] otu.pca <- prcomp(t(count), scale. = TRUE) ggbiplot(otu.pca, obs.scale = 1, var.scale = 1,groups = group$genotype, ellipse = TRUE,ellipse.prob = 0.68,labels =NULL, labels.size = 3, alpha = 1,var.axes = F) |
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deephill
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