24小时热门版块排行榜    

查看: 4104  |  回复: 10
【奖励】 本帖被评价7次,作者zhycan增加金币 5.1 个
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zhycan

银虫 (著名写手)


[资源] 分享:推荐一些常用的在线分析工具-分子生物学方面的

综合工具
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool)
http://www.bionavigator.com, 功能最为完整的网上服务器。包括核酸的酶切位点、motif、开读框等搜索,PCR引物设计,二级结构预测,多序列比较及分子进化树构建,等等;蛋白分析则包括酶切图谱,功能区搜索,分子进化分析,蛋白二级结构预测,等等;此外还提供序列管理等功能。收费站点,但提供两周的全功能免费试用期
http://bioinformatics.weizamann.ac.il/gdp/gdp.html, 另一个综合性的提供序列分析功能的网站
http://www.hgsc.bcm.tmc.edu,内容丰富的站点,有数据库及教程、在线分析工具等,常用其预测编码区、搜索启动子和结合位点等功能

编码区统计特性分析
http://cbrg.inf.ethz.ch,常用其基因预测及验证功能,预测DNA序列的外显子。 还有其它一些在线服务

启动子及调控元件分析
BDGP-promoter
Tfsitescan

内含子/外显子剪接位点
NetGene服务的Email地址是:netgene@cbs.dtu.dk
重复序列分析
CENSOR的Email服务地址是:censor@sharon.lpi.org
XBLAST:ftp://ncbi.nlm.nih.gov/pub/jmc
Repbase:ftp://ncbi/nlm.nih.gov/repository/repbase/REF

从氨基酸组成辨识蛋白质
ExPASy:
http://www.expasy.ch/tools/
PROSEARCH:
http://www.embl-heidelberg.de/prs.html

预测蛋白质的物理性质:等电点、分子量、酶切特性、疏水性、电荷分布等
ExPASy:http://www.expasy.ch/tools/,有较多的蛋白分析工具,包括分子量、亲疏水性、表面积、二级结构、与SWISS-PROT数据库收录分子同源性比较、极性、折射率等分析
FASTA:
ftp://ftp.virginia.edu/pub/fasta/
SAPS:
http://www.isrec.isb-sib.ch/software/SAPS_form.html
跨膜区预测:
http://www.isrec.isb-sib.ch/software/tmpred_from.html

蛋白质二级结构预测
nnPredict:
http://www.cmpharm.ucsf.edu/~nomi/nnpredict.html
PredictProtein:
http://cubic.bioc.columbia.edu/predictprotein/
PredictProtein的国内镜像:
http://www.cbi.pku.edu.cn/predictprotein/
SOPMA:
http://pbil.ibcp.fr/
二级结构预测:
www.cmpharm.ucsf.edu/~nomi/nnpredict-instrucs.html

卷曲螺旋预测
COILS:
http://www.ch.embnet.org/software/COILS_form.html
跨膜区段和在膜上的取向预测
TMpred:
http://www.ch.embnet.org/software/TMPRED_form.html
信号肽的剪切位点
SignalP:
http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/
蛋白质的三维结构
SWISS-MODEL:
http://www.expasy.ch/swissmod/SWISS-MODEL.html
CPHmodels:
http://www.cbs.dtu.dk/services/CPHmodels/
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

PCR实验

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhycan

银虫 (著名写手)


的确是个好东西,非常值得一看
11楼2011-03-24 20:10:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

changyz9695

银虫 (正式写手)


分享一下,挺好的
2楼2009-03-27 12:25:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gm7147

金虫 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
3楼2009-04-19 10:03:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jilincr

木虫 (小有名气)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

好东西,谢谢分享
8楼2011-03-10 22:20:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
☆ 无星级 ★ 一星级 ★★★ 三星级 ★★★★★ 五星级
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[博后之家] 【长期招聘】复旦大学 AI 制药实验室 博士后招聘 +3 第三种态度 2026-10-28 9/450 2026-11-02 13:06 by Grace_PepLib
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 YXM1FDCSE8Bn 2026-10-31 6/300 2026-11-02 12:51 by n0P4fnsXKbBK
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 YXM1FDCSE8Bn 2026-10-31 8/400 2026-11-02 12:31 by n0P4fnsXKbBK
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 6/300 2026-11-02 12:25 by n0P4fnsXKbBK
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 YXM1FDCSE8Bn 2026-11-01 6/300 2026-11-02 09:57 by dcc2yOIRGGTT
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 7/350 2026-11-02 09:29 by dcc2yOIRGGTT
[博后之家] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 9/450 2026-11-02 05:54 by xzcv0Tehd8lQ
[论文投稿] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 14/700 2026-11-02 05:41 by xzcv0Tehd8lQ
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +5 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 18/900 2026-11-02 05:34 by xzcv0Tehd8lQ
[找工作] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 5/250 2026-11-01 22:27 by xzcv0Tehd8lQ
[考博] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 7/350 2026-11-01 22:01 by xzcv0Tehd8lQ
[考博] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 7/350 2026-11-01 21:45 by xzcv0Tehd8lQ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 11/550 2026-11-01 21:35 by xzcv0Tehd8lQ
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 5/250 2026-11-01 20:03 by xzcv0Tehd8lQ
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 13/650 2026-11-01 16:48 by BCdvBAEpt3zm
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 7/350 2026-11-01 12:40 by BCdvBAEpt3zm
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 17/850 2026-11-01 12:24 by BCdvBAEpt3zm
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 16/800 2026-11-01 12:14 by BCdvBAEpt3zm
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 X5bHxOULxFqb 2026-10-30 18/900 2026-11-01 12:11 by BCdvBAEpt3zm
[硕博家园] 申博自荐 2篇一区TOP+1篇EI+2公开发明专利 2027博士申请 +3 小小阿光 2026-10-27 3/150 2026-10-29 23:56 by 起风了的快乐
信息提示
请填处理意见