24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 2043  |  回复: 2

小猪100110

新虫 (初入文坛)

[交流] 更新lammps为18版本后,进行计算时出现无效原子ID 已有1人参与

更新lammps为18版本后,进行计算时出现
ERROR on proc 1: Invalid atom ID in Dihedrals section of data file (../atom.cpp:1167)
Last command: read_data            ${fname}
这个错误,之前用17版计算时就不会出错,请问各位大神,是什么原因啊?特别着急,都好久没有解决了。。。。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

apm0SPE

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
手上没有18版的lammps,不过看github上这个错误在atom.ccp:1165而不是1167,代码如下:
    if ((atom1 <= 0) || (atom1 > map_tag_max) ||
        (atom2 <= 0) || (atom2 > map_tag_max) ||
        (atom3 <= 0) || (atom3 > map_tag_max) ||
        (atom4 <= 0) || (atom4 > map_tag_max) ||
        (atom1 == atom2) || (atom1 == atom3) || (atom1 == atom4) ||
        (atom2 == atom3) || (atom2 == atom4) || (atom3 == atom4))
      error->one(FLERR,"Invalid atom ID in Dihedrals section of data file";
拿了一个贼早的版本,相应代码如下:
    if (atom1 <= 0 || atom1 > map_tag_max ||
        atom2 <= 0 || atom2 > map_tag_max ||
        atom3 <= 0 || atom3 > map_tag_max ||
        atom4 <= 0 || atom4 > map_tag_max)
      error->one(FLERR,"Invalid atom ID in Dihedrals section of data file";
所以说,我猜测18版本的lammps中二面角4个原子数不能相等
2楼2018-06-20 19:37:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小猪100110

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by apm0SPE at 2018-06-20 19:37:21
手上没有18版的lammps,不过看github上这个错误在atom.ccp:1165而不是1167,代码如下:
    if ((atom1 &lt;= 0) || (atom1 &gt; map_tag_max) ||
        (atom2 &lt;= 0) || (atom2 &gt; map_t ...

谢谢您的帮助,我之前看到这个文件了,但是不清楚4个原子代表的是什么意思,可以再指导我一下吗?十分感谢
3楼2018-06-20 20:52:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 小猪100110 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +4 崔wj 2026-03-26 4/200 2026-03-28 16:47 by jiyingjie123
[考研] 22408 359分调剂 +3 Qshers 2026-03-27 4/200 2026-03-28 16:45 by Qshers
[考研] 346求调剂 一志愿070303有机化学 +3 萝卜炖青菜 2026-03-28 3/150 2026-03-28 14:11 by 唐沐儿
[考研] 311求调剂 +9 lin0039 2026-03-26 9/450 2026-03-28 13:05 by 唐沐儿
[考研] 286求调剂 +12 PolarBear11 2026-03-26 12/600 2026-03-28 12:14 by zllcz
[考研] 【求调剂】085601材料工程专硕 | 总分272 | +6 脚滑的守法公民 2026-03-27 6/300 2026-03-28 11:02 by gjlllb
[考研] 0856材料化工调剂 总分330 +10 zhubinhao 2026-03-27 10/500 2026-03-28 03:34 by fmesaito
[考研] 一志愿吉大071010,316分求调剂 +3 xgbiknn 2026-03-27 3/150 2026-03-27 10:36 by guoweigw
[考研] 324求调剂 +8 hanamiko 2026-03-26 10/500 2026-03-27 08:06 by hypershenger
[考研] 341求调剂 +7 青柠檬1 2026-03-26 7/350 2026-03-27 00:19 by wxiongid
[考研] 071000生物学求调剂,初试成绩343 +6 小小甜面团 2026-03-25 6/300 2026-03-26 23:01 by 不吃魚的貓
[考研] 求调剂 一志愿 本科 北科大 化学 343 +6 13831862839 2026-03-24 7/350 2026-03-26 22:57 by 不吃魚的貓
[考研] 327求调剂 +7 prayer13 2026-03-23 7/350 2026-03-26 20:48 by 不吃魚的貓
[考研] 材料调剂 5+4 想要一壶桃花水 2026-03-25 10/500 2026-03-26 19:56 by 不吃魚的貓
[考研] 材料考研求调剂 +3 Dendel 2026-03-23 6/300 2026-03-26 17:51 by fmesaito
[考研] 263求调剂 +6 yqdszhdap- 2026-03-22 10/500 2026-03-26 13:11 by 公瑾逍遥
[考研] 一志愿武理085500机械专业总分300求调剂 +3 an10101 2026-03-24 7/350 2026-03-25 00:00 by 山鬼0-
[考研] 085404电子信息284分求调剂 +4 13659058978 2026-03-24 4/200 2026-03-24 12:15 by syl20081243
[基金申请] 请教下大家 2026年国家基金申请是双盲审吗? +3 lishucheng1 2026-03-22 5/250 2026-03-24 08:22 by gltch
[考研] 一志愿东华大学化学070300,求调剂 +7 2117205181 2026-03-21 8/400 2026-03-22 22:55 by chixmc
信息提示
请填处理意见