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du20131580

金虫 (正式写手)

[交流] 启动子连接载体 已有2人参与

最近在做重组实验,将载体原有启动子切掉换成自己要用的启动子序列。长度大约1800bp,用的双酶切,连接转化做了好几次,LB板上有单克隆菌落,但是每次菌p的时候都没有目的条带,菌p引物用的是启动子上游和载体报告基因的下游,预计阳性条带大小为2100bp左右,做了好几次都没有条带,这个可能是什么原因呀,要怎么改进呢?

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Huobol

至尊木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
8楼: Originally posted by du20131580 at 2018-06-19 04:59:30
这下清醒了...您说的设计引物确认一下是说用酶切之后的载体为模板扩35S吗,没有带的话说明切下来的确实是?
...

这个能好用吗,估计有一丁点没有酶切的质粒存在就能pcr扩出量带吧,除非酶切的完完全全吧。

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让羽毛再飞一会儿
9楼2018-06-19 09:28:39
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Huobol

至尊木虫 (著名写手)

★ ★ ★
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2018-06-19 07:41:29
用的pBI121载体吗?这个载体好难弄啊,查了查帖子,这个载体的拷贝数超低,怎么也得摇菌40 mL去提质粒,否则质粒浓度太低,做双酶切都不好做,必将还要切胶回收损失很大。准备今天摇它40 mL试试,看看能不能提高质粒浓度为双酶切做准备,不过这得用多少提质粒的试剂啊,怎么也得10次量的。

不知楼主的质粒双酶切浓度如何,如果浓度低,可能就是质粒模板的浓度不够。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

让羽毛再飞一会儿
2楼2018-06-18 22:23:54
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du20131580

金虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by Huobol at 2018-06-18 22:23:54
用的pBI121载体吗?这个载体好难弄啊,查了查帖子,这个载体的拷贝数超低,怎么也得摇菌40 mL去提质粒,否则质粒浓度太低,做双酶切都不好做,必将还要切胶回收损失很大。准备今天摇它40 mL试试,看看能不能提高质粒 ...

谢谢回复~。
载体用的本实验室改造过的pCAMBIA1304,提质粒浓度还可以。载体双切的时候凝胶成像很明显可以看到原载体的启动子被切下来了。连接体系10微升 :6微升双切后的目的片段,2微升的buffer,0.5微升的T4连接酶,2微升的载体。转化DH5α。今天问了问师兄,目的片段和载体重新4+4试试看看能不能好点。
另外,我的目的片段是加酶切位点引物kod酶PCR后纯化再双切的,没有经过T载过渡,这个会不会导致目的片段末端有问题呀。

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3楼2018-06-18 22:44:07
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海阔天空_812

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
换一下连接体系的比例吧

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4楼2018-06-19 00:01:32
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