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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 氢键类错误求助，谢谢
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李禹蒙123

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1楼 2018-06-08 19:42:49
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DJ_Tokyo

新虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
李禹蒙123: 金币+30, ★有帮助 2018-06-08 20:53:37
限制一下距离试试，用difx命令
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2楼2018-06-08 20:41:31
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DJ_Tokyo

新虫 (知名作家)
引用回帖:
2楼: Originally posted by DJ_Tokyo at 2018-06-08 20:41:31
限制一下距离试试，用difx命令

写错了，是dfix
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3楼2018-06-08 20:41:48
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李禹蒙123

禁虫 (小有名气)
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4楼2018-06-08 20:47:06
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DJ_Tokyo

新虫 (知名作家)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 李禹蒙123 at 2018-06-08 20:47:06
具体应该怎么弄啊，先把氢删掉？...

比如第一个，就在ins中添加如下命令：

DFIX 1.80 0.01 H1B H4B

尝试比1.51大的数字，然后精修试试，如果还是消不掉，再尝试更大一点的数字
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5楼2018-06-08 21:08:32
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我想更懂你29

专家顾问 (文坛精英)
这种问题要找到什么原因引起的，是不是需要修无序之类的，据我说知，氢氢距离要达到2.10埃才不会出现在B-alert里，简单的dfix很难起到效果，所以把数据发上来看看吧
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李禹蒙123
以大多数人的努力程度，还轮不到去拼天赋的地步
6楼2018-06-08 21:18:08
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李禹蒙123

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7楼2018-06-08 21:38:12
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李禹蒙123

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8楼2018-06-09 09:34:38
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DJ_Tokyo

新虫 (知名作家)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 李禹蒙123 at 2018-06-09 09:34:38
不知道上传hkl和cif文件可以不？麻烦老师帮我看下问题在哪。最后还是想知道具体的解决办法，因为我看到好多这样 的错误了，万分感谢...

相关信息自己填写一下吧，

你那个羧基不应该加氢的，否则电荷不平衡了
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李禹蒙123
9楼2018-06-10 10:53:05
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李禹蒙123

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10楼2018-06-11 08:16:45
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