应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】判断平衡
71/1返回列表
查看: 630  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。

renwenpo

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】判断平衡

MD研究溶液体系，如何判断溶液达到平衡，有什么判断标准和依据么？
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2009-03-26 08:05:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sss3012

银虫 (正式写手)
★
renwenpo(金币+1,VIP+0):谢谢 3-26 10:33
看能量，能量达到最小值时应该就是平衡的条件
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2009-03-26 09:23:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qasd

木虫 (著名写手)
★
renwenpo(金币+1,VIP+0):谢谢 3-26 10:33
势能相对稳定
回复此楼
3楼2009-03-26 09:23:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

renwenpo

金虫 (小有名气)
我做的是溶质在溶液中的构象，看能量的话，一般几十ps就稳定了，但这样的模拟时间相对较短，还有没有更好的判断方法？
赞一下 回复此楼
4楼2009-03-26 10:32:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qasd

木虫 (著名写手)
★
wuchenwf(金币+1):谢谢
小分子？那很正常
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2009-03-26 14:37:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
qasd(金币+2,VIP+0):谢谢 3-26 17:35
renwenpo(金币+2,VIP+0):谢谢 3-27 08:08
通常来讲，MD在给定条件下运行至能量、温度等波动很小的时候就算达到平衡了。常用的标准是波动小于正负5%。这是过去常用的，现在我觉得计算能力提高了，可以再要求严格一点，大概波动小于3%吧。也就是说，你视为平衡，并用于做统计平均的那些构型，能量或温度等计算中不断波动的量，波动范围不应大于正负3%。对于压力，因为不容易算准，可以用5%吧。呵呵。


但是现在，很少有人去真正论证是否平衡的问题。我觉得如果统计平衡性质，步数（时间）应该尽量做长一些，当然是越长越好，看你的计算机能力了。
赞一下(8人) 回复此楼
6楼2009-03-26 17:09:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
qasd(金币+1,VIP+0):谢谢，期待更多参与讨论~ 3-26 17:36
renwenpo(金币+3,VIP+0):谢谢 3-27 08:08
我以上说的是简单的判定平衡的标准，供自己掌握，但如果要严格讨论，这5%或3%就上不了台面了。实际上如果严格讨论，也有一些“参数”可以参考的，详情可见
A.R.Leach, Molecular Modelling-- principles and applications 一书的第5.6节" Monitoring the equilibration"。也许其它的书上也有介绍吧。
赞一下(7人) 回复此楼
7楼2009-03-26 17:16:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 renwenpo 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 7/350 2026-11-01 02:33 by YXM1FDCSE8Bn
[找工作] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 5/250 2026-11-01 02:28 by YXM1FDCSE8Bn
[考博] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 5/250 2026-11-01 02:25 by YXM1FDCSE8Bn
[博后之家] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 14/700 2026-11-01 02:06 by YXM1FDCSE8Bn
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 13/650 2026-11-01 02:02 by YXM1FDCSE8Bn
[论文投稿] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 7/350 2026-11-01 00:48 by YXM1FDCSE8Bn
[找工作] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 5/250 2026-11-01 00:44 by YXM1FDCSE8Bn
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 12/600 2026-11-01 00:35 by YXM1FDCSE8Bn
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 X5bHxOULxFqb 2026-10-30 15/750 2026-11-01 00:22 by YXM1FDCSE8Bn
[基金申请] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 X5bHxOULxFqb 2026-10-30 19/950 2026-11-01 00:17 by YXM1FDCSE8Bn
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 X5bHxOULxFqb 2026-10-30 12/600 2026-11-01 00:15 by YXM1FDCSE8Bn
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 7/350 2026-10-31 23:18 by YXM1FDCSE8Bn
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 6/300 2026-10-31 23:17 by YXM1FDCSE8Bn
[博后之家] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 5/250 2026-10-31 23:10 by YXM1FDCSE8Bn
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 9/450 2026-10-31 21:34 by YXM1FDCSE8Bn
[教师之家] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 X5bHxOULxFqb 2026-10-30 13/650 2026-10-31 17:12 by hKe7U1kad5Sg
[考博] 2027博士申请-临床检验诊断学、病原生物学、微生物方向 50+3 yyh@ 2026-10-28 4/200 2026-10-31 12:47 by 可淡不可忘
[基金申请] 论文的挂名怎么评判贡献？基金申请中，排名第一的挂名文章 +3 biily 2026-10-25 3/150 2026-10-30 18:33 by 旁观2020
[文学芳草园] 闲聊 +3 myrtle 2026-10-25 6/300 2026-10-29 15:28 by myrtle
[考博] 申博求助 20+3 Katrinae 2026-10-26 4/200 2026-10-27 09:56 by 北京莱茵编辑
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭